当前解析结果
SmilChr04G003424| 统一新 Gene ID | SmilChr04G003424 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G003424 |
| 描述 | glycine-rich cell wall structural protein-like |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 50827045 - 50829317 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131023571 |
|---|---|
| GeneID | 131023571 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023571 |
| 原始查询 | LOC131023571 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | glycine-rich cell wall structural protein-like |
| 产物 | glycine-rich cell wall structural protein-like |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023571 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057809098.1 |
| 2 | Secreted | 分泌到胞外 | 0.20000 | XP_057809098.1 |
| 3 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.20000 | XP_057809098.1 |
| 4 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057809098.1 |
| 5 | Peroxisome | 过氧化物酶体 | 0.20000 | XP_057809098.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:50827056 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B12 |
Chr4:50827111 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B139,B83,C46,C57,C84 |
Chr4:50829060 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B75 |
Chr4:50829074 |
G |
GC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 2 | A4,B136 |
Chr4:50829074 |
G |
GC |
1bp_insertion | CDS_variant | 2 | A4,B136 |
Chr4:50829107 |
A |
AC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 19 | A1,A16,A7,B13,B131,B60,B62,B71,B72,B90,C1,C2,C21,C40,C62,C67,C80,C86,C87 |
Chr4:50829124 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | C53,D1 |
Chr4:50829124 |
AG |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | C53,D1 |
Chr4:50829183 |
CCA |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | D5 |
Chr4:50829183 |
CCA |
C |
2bp_deletion | CDS_variant | 1 | D5 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。