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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003455`

染色体: Chr04 坐标: 51036600-51038018 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003455`
名称	SmilChr04G003455
描述	expansin-A4-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	51036600 - 51038018 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023573`
GeneID	`131023573`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023573`
原始查询	`LOC131023573`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	expansin-A4-like
产物	expansin-A4-like
Arabidopsis	`AT5G39280` (EXPA23) expansin A23 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833924] identity=56.5; qcov=0.858; evalue=9.8e-95; confidence=high
Rice	`Os05g0477600` (OsEXP4) - identity=56.3; qcov=0.854; evalue=4.41e-89; confidence=high
GO	GO:0005576 (extracellular region); GO:0009664 (plant-type cell wall organization)
KEGG	-
Pfam	PF01357 (Expansin_C); PF03330 (DPBB_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023573

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057809100.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057809100.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809100.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809100.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809100.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:51036615`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr4:51036649`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr4:51036714`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C2
`Chr4:51036722`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B100
`Chr4:51036747`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr4:51036759`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,A7,B41,C73
`Chr4:51036803`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,C48,C80
`Chr4:51036831`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B26,B60,B76,C16
`Chr4:51036840`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C2
`Chr4:51036848`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr4:51036864`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,D5
`Chr4:51036887`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809100.1

268 aa

134

268

DPBB_1

Expansin_C

PF03330 DPBB_1 81-164 aa PF01357 Expansin_C 175-252 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809100.1`	Pfam	`PF03330`	DPBB_1	Domain	81	164	3.2e-21	76.1	Lytic transglycolase
`XP_057809100.1`	Pfam	`PF01357`	Expansin_C	Domain	175	252	2.6e-24	85.9	Expansin C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953117.1
ATGGGTTTTGATGAAGTGATGTTGCTTGGTTTAGCAGGCATTTGTGCAGTATTTTTGTGTGTTAATGCGAGTGGAAGTGACAACGATACTACCATCTTAGAAGGGCATGGATGGGATCTCGCTCGTGCAACCTTCTACGGCCCACCCGATGCCAATGATGGAATGGAATTAATTTTTTGGTTTTTGGTAGGAGGAGCATGTGGATACACAAACGTGTTCCAGCAAGGGTACGGCCAAGAGACGACGGCTCTAAGCACCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023573
ATGGGTTTTGATGAAGTGATGTTGCTTGGTTTAGCAGGCATTTGTGCAGTATTTTTGTGTGTTAATGCGAGTGGAAGTGACAACGATACTACCATCTTAGAAGGGCATGGATGGGATCTCGCTCGTGCAACCTTCTACGGCCCACCCGATGCCAATGATGGAATGGAATTAATTTTTTGGTTTTTGGTAGGAGGAGCATGTGGATACACAAACGTGTTCCAGCAAGGGTACGGCCAAGAGACGACGGCTCTAAGCACCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809100.1
MGFDEVMLLGLAGICAVFLCVNASGSDNDTTILEGHGWDLARATFYGPPDANDGMELIFWFLVGGACGYTNVFQQGYGQETTALSTALFNDGAACGACFEIVCVNAPQACKKGVIRVTATNFCPPDYSKTQDLWCNPPQKHFDLAQPMFLKIAEYRAGVVPVAYRRVKCGKRGGIKFVMGGNNYWTLVLVYNVGGVGDVKSVRVRSSGSDWTWMSRNWGQNWQLTQSLLGKTLSFEVTTSDGSVMQEIDVVPSSWGFGMT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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