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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002125`

染色体: Chr01 坐标: 37245846-37251767 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002125`
名称	SmilChr01G002125
描述	uncharacterized SmilChr01G002125
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	37245846 - 37251767 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023574`
GeneID	`131023574`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023574`
原始查询	`LOC131023574`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02992 (Transposase_21); PF03004 (Transposase_24); PF13952 (DUF4216); PF13960 (DUF4218); PF13963 (Transpos_assoc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023574

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809103.1`
2	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057809103.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809108.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809108.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809108.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:37246312`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr1:37246505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr1:37246653`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B62,C49
`Chr1:37246702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B121
`Chr1:37246745`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B48
`Chr1:37246815`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B27,B41
`Chr1:37248213`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:37248224`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:37248288`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809103.1

1128 aa

564

1128

Transpos_assoc

Transposase_21

DUF4218

DUF4216

PF13963 Transpos_assoc 5-81 aa PF02992 Transposase_21 291-503 aa PF13960 DUF4218 687-800 aa PF13952 DUF4216 967-1039 aa

XP_057809108.1

377 aa

188

377

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 174-300 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809103.1`	Pfam	`PF13963`	Transpos_assoc	Domain	5	81	3e-19	69.7	Transposase-associated domain
`XP_057809103.1`	Pfam	`PF02992`	Transposase_21	Family	291	503	1.2e-79	267.2	Transposase family tnp2
`XP_057809103.1`	Pfam	`PF13960`	DUF4218	Domain	687	800	1.2e-42	145.0	Domain of unknown function (DUF4218)
`XP_057809103.1`	Pfam	`PF13952`	DUF4216	Domain	967	1039	4.1e-19	69.6	Domain of unknown function (DUF4216)
`XP_057809108.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	174	300	4.6e-11	43.7	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953125.1
CCACCAATTCTTGTTCATCCCCTCGGTGGAATCGTTGACATTGAAGATGACGATGACCCAGAAGACGACGACCAATCGTTGACATCTGATGACGCCAGTAATGATGACGACGCCAGTAATGATGATGACAGTAGTTGAGGTACCATGTCTCATCGTAGAGGATTGTTGGGGTTTGGTAGTCGGTCTTCTAGGCCTGAGGCACAGTCCTCCTCAGGCTCTGGGCCGTATATTTCCGCTACTCCAGAGTCTGGTTCCCCTCC...

XM_057953120.1
AATTACTTTATAGGATGTTTAAAGTATGATAAATTGAAATTAATTTGGTAATTAGATACTTTATAGGATGTTTAAAGTATGATTAATTGAAATTAATTTGGTAATTAGATTAATTATGAATTGATTTAACTGTAGTTACTTTATAGGATGTTTAAAGTATGATTAATTGAAATTAATTTGTTAATTAGATTAATTTTAAATTGATTTTCTGTTTTGGATGAAATGATATGTTATTATATATTGTGGGATAGATTTAATCA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131023574
ATGTCTCATCGTAGAGGATTGTTGGGGTTTGGTAGTCGGTCTTCTAGGCCTGAGGCACAGTCCTCCTCAGGCTCTGGGCCGTATATTTCCGCTACTCCAGAGTCTGGTTCCCCTCCACAGAGCGCTGCTGCATCTGGGTCTAGAAGGCCCAAAGGCAAATCAGTGGCGCAGATTAGGGCTGAGTGTGTTAGGCGCGACGGGAGGATCCTCTTTCAGAGGAATACTGTTGGTAAGTTGATCGAGCCCCCGGGGATCTCCAC...

LOC131023574
ATGAGTGATAATCGATCGTGGATGTACGCGAGATACAATGATCGTGCTGCATTTGAAACGGGACTTGAGAGTTTCCTCGAGTTTGCGATAAATCAAACAGCGTATACAGATGGAATTGGTAACATTAGGTGCCCGTGTAGGAAGTGTAAGAATAAAGTCTTTGCATCTGTACCTACAGTCAGAGAACATGTTACTAGGCGTGGATTTGTCCACAATTACACGAACTGGTGTTATCAAGGGGAAGCACCAGTGTATATGCC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057809103.1
MSDNRSWMYARYNDRAAFETGLESFLEFAINQTAYTDGIGNIRCPCRKCKNKVFASVPTVREHVTRRGFVHNYTNWCYQGEAPVYMPAEHTIMDEDDGSYSNYQRMVHDHAGPSNYQDPPNLEEPPNPDAQQIYDMLNAADSPLYPDCDTYSQLSWMTQMMSIKVENHMSERCFNQISEMVQKALPKDNNCPDSFYSTKRNLRGLGLPVEKIDCCVNNCMLYWGDDSELESCNFCGASRYKENLRASGSRRKKRVAAKQM...

XP_057809108.1
MSHRRGLLGFGSRSSRPEAQSSSGSGPYISATPESGSPPQSAAASGSRRPKGKSVAQIRAECVRRDGRILFQRNTVGKLIEPPGISTCCTNSFKRIPNPGGYTWKLTPPTVQELYFEEFKKEFTWDPEDEADVKKMWLEKARKRYSDNMSEYKRLLKQKTEAGEMMETPLGMSDTFWTGLKAYWDQDEVKAVSRRARENRYSEPDGVGTGISRHVGGSQSSRILQQSLLVDGEVPPTASNYSTFLFLHMYADGTFVSEKD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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