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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003469`

染色体: Chr04 坐标: 51170878-51171796 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003469`
名称	SmilChr04G003469
描述	histone deacetylase 5-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	51170878 - 51171796 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023577`
GeneID	`131023577`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023577`
原始查询	`LOC131023577`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	histone deacetylase 5-like
产物	histone deacetylase 5-like
Arabidopsis	`AT5G61060` (HDA05) histone deacetylase 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836227] identity=53.5; qcov=0.929; evalue=1.95e-56; confidence=high
Rice	`Os07g0602200` - identity=55.2; qcov=0.842; evalue=1.13e-50; confidence=medium
GO	GO:0000118 (histone deacetylase complex); GO:0004407 (histone deacetylase activity); GO:0006325 (chromatin organization); GO:0016575 (GO:0016575)
KEGG	-
Pfam	PF00850 (Hist_deacetyl)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023577

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057809104.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057809104.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809104.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809104.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809104.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:51170923`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B138,B52,C32,D7
`Chr4:51170927`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B138,B52,B83,C32
`Chr4:51170952`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B73,B83,C75,C82
`Chr4:51171061`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,D5
`Chr4:51171727`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:51171770`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B108,B30,B59,B61,C42,D7
`Chr4:51171775`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B108,B30,B59,B61,C42,D7
`Chr4:51171782`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B108,B59
`Chr4:51171782`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B108,B59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809104.1

183 aa

183

Hist_deacetyl

PF00850 Hist_deacetyl 38-173 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809104.1`	Pfam	`PF00850`	Hist_deacetyl	Domain	38	173	4e-32	112.5	Histone deacetylase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953121.1
ATGAAGAAAATGAGCAGAAGTAGCAAGGACTGTGTCAGCGGTAGAGACCGGCGGGTGGGTTTGATATTTGACGAGCGGATGTATAAACACTACGCTCCTCATGAAAAGGATCATGCTGAATGCCCTGATCGGATTCGGGTCATCTGGGACCTCCTCAATTCTTCTGGCCTCGACAAAAGGTCCCTTCTTTCACCCACAAACCACAATGTGTATTATTTTGAAGGCCATTTAGCCTTGGTTCACACCCAAAACCATATCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023577
ATGAAGAAAATGAGCAGAAGTAGCAAGGACTGTGTCAGCGGTAGAGACCGGCGGGTGGGTTTGATATTTGACGAGCGGATGTATAAACACTACGCTCCTCATGAAAAGGATCATGCTGAATGCCCTGATCGGATTCGGGTCATCTGGGACCTCCTCAATTCTTCTGGCCTCGACAAAAGGTCCCTTCTTTCACCCACAAACCACAATGTGTATTATTTTGAAGGCCATTTAGCCTTGGTTCACACCCAAAACCATATCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809104.1
MKKMSRSSKDCVSGRDRRVGLIFDERMYKHYAPHEKDHAECPDRIRVIWDLLNSSGLDKRSLLSPTNHNVYYFEGHLALVHTQNHITLIKNISSKNTKSKRKRIAENFDSIYFNEGSTEAACLAAGSVIEAAEKVAKGEIDSAFAIVRPPGHHAEEAEPMGFCLYNNVAIALGKPIKESFSNL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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