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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003524`

染色体: Chr04 坐标: 51604902-51608912 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003524`
名称	SmilChr04G003524
描述	protein RKD1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	51604902 - 51608912 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023588`
GeneID	`131023588`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023588`
原始查询	`LOC131023588`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein RKD1-like
产物	protein RKD1-like
Arabidopsis	`AT1G18790` (RKD1) RWP-RK domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838461] identity=64.9; qcov=0.506; evalue=1.22e-51; confidence=medium
Rice	`Os06g0228950` - identity=63.7; qcov=0.479; evalue=8.09e-48; confidence=medium
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity)
KEGG	-
Pfam	PF02042 (RWP-RK)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023588

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809114.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809114.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809114.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809114.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057809114.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:51608118`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr4:51608121`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr4:51608299`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr4:51608349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:51608409`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B29
`Chr4:51608409`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B29
`Chr4:51608788`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	160	A10,A11,A14,A16,A18,A19,A2,A20,A22,A3,A6,A7,A8,B100,B101,B102,B103,B105,B106,B107,B109,B11,B111,B112,B113,B114,B117,B119,B120,B122,B128,B129,B130,B132,B136,B137,B139,B14,B140,B17,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B3,B30,B33,B35,B38,B39,B4,B40,B42,B43,B44,B45,B46,B48,B49,B50,B51,B53,B54,B56,B59,B6,B60,B63,B64,B65,B66,B68,B69,B7,B71,B72,B73,B76,B79,B8,B83,B84,B85,B87,B89,B90,B91,B92,B93,B94,B96,B97,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C18,C19,C2,C21,C24,C25,C26,C27,C29,C3,C31,C32,C33,C39,C4,C40,C42,C45,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C57,C58,C59,C6,C62,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C75,C76,C77,C78,C79,C80,C81,C82,C83,C85,C9,D1,D10,D11,D2,D5,D6,D8
`Chr4:51608807`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B137
`Chr4:51608807`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B137

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809114.1

259 aa

130

259

RWP-RK

PF02042 RWP-RK 121-210 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809114.1`	Pfam	`PF02042`	RWP-RK	Domain	121	210	1.6e-28	99.3	RWP-RK domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953131.1
ATGGAGATTACCGAGTCTCTCAACATGGGATGGTCAAAATACAATCAAGCGCTCGCAACAATTCCCAAAGAAGACTACGACGATGTTTTCTCCATCCCATCCCACACTTCCACCACTCGATTGAGTGGAATTCTTGGTTTTCATGGCTACGAGTTTGGGATGGAAGAAACAGTTGTCGAAGTTATCTTGAGCGATCCTGGGAGTGTATTTTTGGATGACGGAGTGCAGGTTCAACAGAAGCGCAGAAAGCTGCTTCTGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023588
ATGGAGATTACCGAGTCTCTCAACATGGGATGGTCAAAATACAATCAAGCGCTCGCAACAATTCCCAAAGAAGACTACGACGATGTTTTCTCCATCCCATCCCACACTTCCACCACTCGATTGAGTGGAATTCTTGGTTTTCATGGCTACGAGTTTGGGATGGAAGAAACAGTTGTCGAAGTTATCTTGAGCGATCCTGGGAGTGTATTTTTGGATGACGGAGTGCAGGTTCAACAGAAGCGCAGAAAGCTGCTTCTGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809114.1
MEITESLNMGWSKYNQALATIPKEDYDDVFSIPSHTSTTRLSGILGFHGYEFGMEETVVEVILSDPGSVFLDDGVQVQQKRRKLLLLDYNINGATINDDKLLIIGEDKRGIKRSLEEEEDGTKTSKKLTRQMISQYFYMPITQAARELNVGLTLLKKRCRELGIRRWPHRKLMSLQTLIKNVQEFGKEEGEGKLQESLEILEQEKKLMEEIPDLQLEDKTKRLRQAFFKANYKKRKLMGRIDSSSKSVAPTSGCDVCIA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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