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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003547`

染色体: Chr04 坐标: 51818716-51820269 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003547`
名称	SmilChr04G003547
描述	transcription factor MYB4-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	51818716 - 51820269 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023589`
GeneID	`131023589`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023589`
原始查询	`LOC131023589`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor MYB4-like
产物	transcription factor MYB4-like
Arabidopsis	`AT1G08810` (MYB60) myb domain protein 60 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837403] identity=88.4; qcov=0.27; evalue=2.08e-23; confidence=weak
Rice	`Os07g0484700` - identity=67.8; qcov=0.371; evalue=6.63e-24; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023589

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057809115.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057809115.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809115.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809115.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809115.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:51819071`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B13
`Chr4:51819071`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B13
`Chr4:51819080`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B41,B85
`Chr4:51819080`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B41,B85
`Chr4:51819349`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A19,A4,B34,B83,B94,B97,C72,C75
`Chr4:51819353`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B15,B20,C79
`Chr4:51819427`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B15,C49
`Chr4:51819439`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B15,B20,B52,C79
`Chr4:51819492`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:51819526`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B67,B68,C2,C48
`Chr4:51819536`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr4:51819575`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B67,B68,C2,C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809115.1

159 aa

159

Myb_DNA-binding

PF00249 Myb_DNA-binding 30-64 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809115.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	30	64	5.1e-09	36.8	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953132.1
ATGGCTGGGCAGCAGGTTTCACAATTCGCATCTGCCTTCCTCGCGCAGCCTGCCTTGCCTCTCTCCCACATCCCAGCTGCCGGCGCCTCTTACATTCAACAACACGGTCCTGGAAACTGGAGGGCTGTTCCTACTAACATAGGTTTACTGAGATGCAGCAAGAGCTGCCGCCTCCGCTGGACCAACTATCTTCGGCCGGGCATCCGCCGCGGCAAATCCTCCTCAAGTTTCTCCACCCTATCCAGCAAGTTAGCCGCTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023589
ATGGCTGGGCAGCAGGTTTCACAATTCGCATCTGCCTTCCTCGCGCAGCCTGCCTTGCCTCTCTCCCACATCCCAGCTGCCGGCGCCTCTTACATTCAACAACACGGTCCTGGAAACTGGAGGGCTGTTCCTACTAACATAGGTTTACTGAGATGCAGCAAGAGCTGCCGCCTCCGCTGGACCAACTATCTTCGGCCGGGCATCCGCCGCGGCAAATCCTCCTCAAGTTTCTCCACCCTATCCAGCAAGTTAGCCGCTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809115.1
MAGQQVSQFASAFLAQPALPLSHIPAAGASYIQQHGPGNWRAVPTNIGLLRCSKSCRLRWTNYLRPGIRRGKSSSSFSTLSSKLAAVEAGPLDSPTPHILLHCRRCIAAPAAKPLMRTTYAPPHQNPAPQPPQTPAPLQPASHCGINANNCGRCEVDEF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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