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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003568`

染色体: Chr04 坐标: 52055715-52056212 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003568`
名称	SmilChr04G003568
描述	protein SMALL AUXIN UP-REGULATED RNA 51-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	52055715 - 52056212 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023594`
GeneID	`131023594`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023594`
原始查询	`LOC131023594`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SMALL AUXIN UP-REGULATED RNA 51-like
产物	protein SMALL AUXIN UP-REGULATED RNA 51-like
Arabidopsis	`AT5G20810` (AT5G20810) SAUR-like auxin-responsive protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832204] identity=32.2; qcov=0.867; evalue=1.44e-21; confidence=low
Rice	`Os02g0143400` (OsSAUR5) - identity=40.5; qcov=0.673; evalue=1.37e-20; confidence=low
GO	GO:0009733 (response to auxin)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02519 (Auxin_inducible)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023594

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057809121.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057809121.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057809121.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809121.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809121.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:52055850`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	11	A11,A22,B101,B106,B23,B71,B89,B93,C62,C65,D6
`Chr4:52056004`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B34,C70,C72,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809121.1

165 aa

165

Auxin_inducible

PF02519 Auxin_inducible 16-116 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809121.1`	Pfam	`PF02519`	Auxin_inducible	Domain	16	116	1.2e-24	87.1	Auxin responsive protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953138.1
ATGTCTTCAGCCATGAGAAAAGTGAACGCGATCACCCAAATCGTAAGGCTGAGGCAAGTCGTCAGGCGTTGGAATTCCAATAGCCTCATGAGGAGGGCCGGCTACACTCACTTCTCCGATTCCGACAAACCGCCGGCCCGCCGCACCCCGCCCGGTTCCGTGGCGGTCTATGTTGGGCCGGAGCGGAGTCGGTTCGTTGTTCCGACCCGGTTCTTGAACCTCCCGGTGTTGGTGTCGCTCCTCAACCAGGCCGAAGAGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023594
ATGTCTTCAGCCATGAGAAAAGTGAACGCGATCACCCAAATCGTAAGGCTGAGGCAAGTCGTCAGGCGTTGGAATTCCAATAGCCTCATGAGGAGGGCCGGCTACACTCACTTCTCCGATTCCGACAAACCGCCGGCCCGCCGCACCCCGCCCGGTTCCGTGGCGGTCTATGTTGGGCCGGAGCGGAGTCGGTTCGTTGTTCCGACCCGGTTCTTGAACCTCCCGGTGTTGGTGTCGCTCCTCAACCAGGCCGAAGAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809121.1
MSSAMRKVNAITQIVRLRQVVRRWNSNSLMRRAGYTHFSDSDKPPARRTPPGSVAVYVGPERSRFVVPTRFLNLPVLVSLLNQAEEEFGYQAAGAITLPCEAGFFACIIHLLEKDEKSFHGLELNEFVEMVSATRFQSCDQSCKGSYLSPPAFCAVTPLLHKARV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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