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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003594`

染色体: Chr04 坐标: 52369171-52376162 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003594`
名称	SmilChr04G003594
描述	putative UDP-glucuronate:xylan alpha-glucuronosyltransferase 4
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	52369171 - 52376162 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023600`
GeneID	`131023600`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023600`
原始查询	`LOC131023600`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative UDP-glucuronate:xylan alpha-glucuronosyltransferase 4
产物	putative UDP-glucuronate:xylan alpha-glucuronosyltransferase 4
Arabidopsis	`AT1G54940` (PGSIP4) plant glycogenin-like starch initiation protein 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841934] identity=47.1; qcov=1.05; evalue=1.42e-178; confidence=high
Rice	`Os01g0880200` (P0018C10.44-1) - identity=45; qcov=0.93; evalue=5.7e-152; confidence=medium
GO	GO:0016757 (glycosyltransferase activity); GO:0045492 (xylan biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF01501 (Glyco_transf_8); PF28720 (GUX1-5_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023600

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057809126.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057809126.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809126.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809126.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809126.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:52369174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,C19,C71
`Chr4:52369323`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr4:52369350`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B35,B41,B85,C15,C40
`Chr4:52369384`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B77,C11,C69
`Chr4:52369437`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr4:52369522`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B22,B93,B99
`Chr4:52369579`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr4:52369728`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B37
`Chr4:52369728`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr4:52369853`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B140,B27,B91
`Chr4:52375396`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B132,B21,B50,B54,B87
`Chr4:52375435`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809126.1

526 aa

263

526

GUX1-5_N

Glyco_transf_8

PF28720 GUX1-5_N 46-222 aa PF01501 Glyco_transf_8 247-349 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809126.1`	Pfam	`PF28720`	GUX1-5_N	Domain	46	222	2.5e-46	158.3	GUX1-5 N-terminal domain
`XP_057809126.1`	Pfam	`PF01501`	Glyco_transf_8	Family	247	349	1.1e-16	61.9	Glycosyl transferase family 8

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953143.1
ATGGCGTCGAAGCCGAAGCCCCACACCTCTTCCTTCATCCTTTTCTTGATAGCCCTCCTAGTCTTCACCATCTACTACCTACGACAGCTGCACGACTGCTTCCAAAGCGCAGTAACCTACTCGGAACCATCTACCAATCCCGACTGGTACGACGTCATTGCGAGGGACGTGGGAGACGAGCGGATGATCAACATCGGGCTGCTGAACATGGACGGCGATGAAACGGCGGCGTTGGAGGCCAAGGGGAAGGTGGTGAAGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023600
ATGGCGTCGAAGCCGAAGCCCCACACCTCTTCCTTCATCCTTTTCTTGATAGCCCTCCTAGTCTTCACCATCTACTACCTACGACAGCTGCACGACTGCTTCCAAAGCGCAGTAACCTACTCGGAACCATCTACCAATCCCGACTGGTACGACGTCATTGCGAGGGACGTGGGAGACGAGCGGATGATCAACATCGGGCTGCTGAACATGGACGGCGATGAAACGGCGGCGTTGGAGGCCAAGGGGAAGGTGGTGAAGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809126.1
MASKPKPHTSSFILFLIALLVFTIYYLRQLHDCFQSAVTYSEPSTNPDWYDVIARDVGDERMINIGLLNMDGDETAALEAKGKVVKVELEPLDKGVQWSDLFPEWINESSTMTSCPELSMPEFGRYEELDVVVARVPCNKCEESGWRDVARLHVNLVVANLLVRSGRVGSGRPLFAVFVGCCGPMWEIFRCDDLLLRVADSWIYKPQLRRLKQIVRLPVGTCQVTPPSPQSGEELSEEKAREAYVTVLHSSEAYVCGAIA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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