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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003595`

染色体: Chr04 坐标: 52388353-52389866 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003595`
名称	SmilChr04G003595
描述	putative UDP-glucuronate:xylan alpha-glucuronosyltransferase 4
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	52388353 - 52389866 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023601`
GeneID	`131023601`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023601`
原始查询	`LOC131023601`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative UDP-glucuronate:xylan alpha-glucuronosyltransferase 4
产物	putative UDP-glucuronate:xylan alpha-glucuronosyltransferase 4
Arabidopsis	`AT1G54940` (PGSIP4) plant glycogenin-like starch initiation protein 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841934] identity=47.9; qcov=1.04; evalue=2.78e-160; confidence=high
Rice	`Os01g0880200` (P0018C10.44-1) - identity=43.7; qcov=1.04; evalue=3.9e-141; confidence=medium
GO	GO:0016757 (glycosyltransferase activity); GO:0045492 (xylan biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF01501 (Glyco_transf_8); PF28720 (GUX1-5_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023601

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057809127.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809127.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809127.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809127.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809127.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:52388814`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C78
`Chr4:52388844`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B19,C76,D8
`Chr4:52388846`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,C22
`Chr4:52388869`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B41,B85,C78
`Chr4:52389038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B4,B44,C19,C71
`Chr4:52389384`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr4:52389419`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B76,C16,C33
`Chr4:52389626`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,C42,C80
`Chr4:52389844`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809127.1

466 aa

233

466

GUX1-5_N

Glyco_transf_8

PF28720 GUX1-5_N 5-159 aa PF01501 Glyco_transf_8 187-289 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809127.1`	Pfam	`PF28720`	GUX1-5_N	Domain	5	159	4.8e-40	137.8	GUX1-5 N-terminal domain
`XP_057809127.1`	Pfam	`PF01501`	Glyco_transf_8	Family	187	289	2.7e-18	67.2	Glycosyl transferase family 8

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953144.1
TTCGACTTCGTTGCTCGACAGATGGGAGACGACACAATCAACATTGCATTGGTGAACATGGGCAAAGCCACCTTGGAAGGCCAGCTTCCCACCAAAGGGAAGATTGTTAAGGTGGATTTCGAGCGCGTGGACGCCGCGTGGTCCGACTTGTATCCGGAGTGGATCGATGAGACCTCTGCCAAGTGTCCGGAGCTACCCATGCCCGTGTTTCAGAACTACGAGAAGCTCGACGTCGTGGTGGCTAGGCTTCCTTCTGATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023601
ATGGGAGACGACACAATCAACATTGCATTGGTGAACATGGGCAAAGCCACCTTGGAAGGCCAGCTTCCCACCAAAGGGAAGATTGTTAAGGTGGATTTCGAGCGCGTGGACGCCGCGTGGTCCGACTTGTATCCGGAGTGGATCGATGAGACCTCTGCCAAGTGTCCGGAGCTACCCATGCCCGTGTTTCAGAACTACGAGAAGCTCGACGTCGTGGTGGCTAGGCTTCCTTCTGATCAGGAATTTGGATTGAGGGATGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809127.1
MGDDTINIALVNMGKATLEGQLPTKGKIVKVDFERVDAAWSDLYPEWIDETSAKCPELPMPVFQNYEKLDVVVARLPSDQEFGLRDVFRLQVNLVVANLLVRCGRVESRPIYAVFIGSSGPMWEIFRCDDLVLHDADSWIYKPQMRRIRQIVRMPVGSCQLNPPLPHHGEELGIERWKQGREAYATILHSNDKYVCGAIALAQSLIQLNTTKELVVLADDRIPPESIDGLQSAGWKIKRIQRIRNPQSKKNSYNEWNYSK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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