当前解析结果
SmilChr04G003601| 统一新 Gene ID | SmilChr04G003601 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G003601 |
| 描述 | NDR1/HIN1-like protein 26 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 52450900 - 52451640 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131023604 |
|---|---|
| GeneID | 131023604 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023604 |
| 原始查询 | LOC131023604 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | NDR1/HIN1-like protein 26 |
| 产物 | NDR1/HIN1-like protein 26 |
| Arabidopsis | AT4G05220 (AT4G05220)Late embryosis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825870] identity=23.7; qcov=0.772; evalue=2.59e-15; confidence=weak |
| Rice | Os02g0538700- identity=26.7; qcov=0.654; evalue=3.55e-15; confidence=low |
| GO | GO:0005886 (plasma membrane) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023604 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057809129.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057809129.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057809129.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057809129.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057809129.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:52451110 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B91,D10 |
Chr4:52451137 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A2,B113,B133,C42 |
Chr4:52451178 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A19,B83,B97,C75 |
Chr4:52451302 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A2,B113,C42 |
Chr4:52451364 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B105,B35 |
Chr4:52451369 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A18,B120,B13,C48 |
Chr4:52451403 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A19,B83,B97,C42,C75 |
Chr4:52451484 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | C64 |
Chr4:52451484 |
GC |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | C64 |
Chr4:52451492 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B3 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。