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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003605`

染色体: Chr04 坐标: 52515660-52516559 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003605`
名称	SmilChr04G003605
描述	uncharacterized SmilChr04G003605
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	52515660 - 52516559 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023606`
GeneID	`131023606`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023606`
原始查询	`LOC131023606`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0577650; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os11g0577650; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G41980` (AT5G41980) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834203] identity=37.1; qcov=0.957; evalue=3.43e-47; confidence=medium
Rice	`Os11g0577650` - identity=49.5; qcov=0.918; evalue=5.79e-69; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13359 (DDE_Tnp_4); PF26138 (DUF8040)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023606

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809131.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057809131.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057809131.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809131.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809131.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:52515696`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr4:52515723`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr4:52515824`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B131,B53,B97,C67
`Chr4:52515828`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B131,B53,B97,C67
`Chr4:52515846`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C57,D8
`Chr4:52515849`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C37,C59,C85
`Chr4:52515887`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B80,C59
`Chr4:52515900`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B90,C87
`Chr4:52515909`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr4:52515923`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr4:52515934`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr4:52515936`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809131.1

231 aa

116

231

DUF8040

DDE_Tnp_4

PF26138 DUF8040 21-108 aa PF13359 DDE_Tnp_4 139-229 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809131.1`	Pfam	`PF26138`	DUF8040	Domain	21	108	1.8e-24	86.1	Domain of unknown function (DUF8040)
`XP_057809131.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	139	229	3.1e-13	50.4	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953148.1
ATGGGGTCTTACATGCCTGCTTTTAGTATGATTGAACGCATTCCTGATCAAAATAGGCATATGAATAGGCTCGTGGGTGTTAGTGATGTCGATTGTCTCGAGAACTTACGTATGGACCGCAACACTTTCGGTCGACTATGCACTTTGTTACGTGAGTCAGGGGGGTTGTCGGATGGAAGGCACATTAGGGTAGAAGAGCAAGTGGCAATGTTTTTGTCCGTTCTAGCGCACCACAAAAAAAATAGGGTTGTTAGGTTCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023606
ATGGGGTCTTACATGCCTGCTTTTAGTATGATTGAACGCATTCCTGATCAAAATAGGCATATGAATAGGCTCGTGGGTGTTAGTGATGTCGATTGTCTCGAGAACTTACGTATGGACCGCAACACTTTCGGTCGACTATGCACTTTGTTACGTGAGTCAGGGGGGTTGTCGGATGGAAGGCACATTAGGGTAGAAGAGCAAGTGGCAATGTTTTTGTCCGTTCTAGCGCACCACAAAAAAAATAGGGTTGTTAGGTTCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809131.1
MGSYMPAFSMIERIPDQNRHMNRLVGVSDVDCLENLRMDRNTFGRLCTLLRESGGLSDGRHIRVEEQVAMFLSVLAHHKKNRVVRFDFWRSGQTVSRFVHLVLKAVLKLHVDLFVKPVPVPDDCTDSRWRWFKGCLGALDGTYINVMINNADKPRYRTRKGQISTNTLAVCDRNGKFVYVLPGWEGSTADSRILRDSLIRVNGLRVPKGKYYLCDNGYANSEGFLTPYKGI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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