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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003718`

染色体: Chr04 坐标: 53490487-53491750 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003718`
名称	SmilChr04G003718
描述	phospholipase A(1) DAD1, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	53490487 - 53491750 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023617`
GeneID	`131023617`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023617`
原始查询	`LOC131023617`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phospholipase A(1) DAD1, chloroplastic-like
产物	phospholipase A(1) DAD1%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT2G44810` (DAD1) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819090] identity=56.2; qcov=0.995; evalue=1.03e-158; confidence=high
Rice	`Os11g0146600` - identity=49.6; qcov=0.903; evalue=6e-103; confidence=high
GO	GO:0004620 (glycerophospholipase activity); GO:0006629 (lipid metabolic process)
KEGG	smil00564 (Glycerophospholipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00592 (alpha-Linolenic acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01764 (Lipase_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023617

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057809141.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057809141.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.40000	`XP_057809141.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809141.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809141.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:53490535`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr4:53490611`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B64,C38
`Chr4:53490657`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C6,C63
`Chr4:53490657`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C6,C63
`Chr4:53490722`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B36
`Chr4:53490722`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B36
`Chr4:53490745`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr4:53490762`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,B68,B79
`Chr4:53490818`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr4:53490823`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B104
`Chr4:53490867`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	C40,C65
`Chr4:53490867`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	C40,C65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809141.1

413 aa

206

413

Lipase_3

PF01764 Lipase_3 172-326 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809141.1`	Pfam	`PF01764`	Lipase_3	Domain	172	326	4.4e-32	111.6	Lipase (class 3)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953158.1
CGGAGTCCGAACGCCATGCAACATGTTCTCGGCAGCTTCTAGCCAACGCGCCACCACACTGCGGCGGCCGGAGAGAAGTAACACGGTCGCCATCACCGGTTTAAACAAGGTAACAAAATCATGGGAACTAGCACGCGCGGCCAACGCCGCCGGGATCCGCGACAAGTGGATGGAGTTTCAAGGAATCAAGAATTGGGAGGGGCTGCTCGACCCCCTCGACGACGACCTCCGCGACGAGATCCTCAGGTACGGCGAGTTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023617
ATGTTCTCGGCAGCTTCTAGCCAACGCGCCACCACACTGCGGCGGCCGGAGAGAAGTAACACGGTCGCCATCACCGGTTTAAACAAGGTAACAAAATCATGGGAACTAGCACGCGCGGCCAACGCCGCCGGGATCCGCGACAAGTGGATGGAGTTTCAAGGAATCAAGAATTGGGAGGGGCTGCTCGACCCCCTCGACGACGACCTCCGCGACGAGATCCTCAGGTACGGCGAGTTCGTCGAAGCAGCCTACCGCTGCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809141.1
MFSAASSQRATTLRRPERSNTVAITGLNKVTKSWELARAANAAGIRDKWMEFQGIKNWEGLLDPLDDDLRDEILRYGEFVEAAYRCFDFDATSSTYATCMHPEASILTQCDSVTNKKGYKVTRNLYATCGVQLPDWTGRLPAWVSTQSSWIGYVAVCDDADEIARLGRRDVVIAYRGTATCMEWLENLRATLACLPDDMAPDGCESMVQAGFLSLYTSPPPHGGGGDGGGLSLQRSVREEIGKILGEYGGERLSVTVTGH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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