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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003826`

染色体: Chr04 坐标: 54363373-54365077 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003826`
名称	SmilChr04G003826
描述	uncharacterized SmilChr04G003826
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	54363373 - 54365077 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023632`
GeneID	`131023632`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023632`
原始查询	`LOC131023632`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0032196 (transposition)
KEGG	-
Pfam	PF03004 (Transposase_24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023632

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809159.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809159.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809159.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809159.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057809159.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:54363378`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,C77
`Chr4:54363379`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B119,C27,C31,C41
`Chr4:54363392`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,C77,D11
`Chr4:54363401`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B33,B99,D7
`Chr4:54363455`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,C8
`Chr4:54363467`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83
`Chr4:54363479`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C37,D11
`Chr4:54363502`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83
`Chr4:54363506`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B85,B99,D7
`Chr4:54363516`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83
`Chr4:54363541`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,C77
`Chr4:54363550`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,C31,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809159.1

408 aa

204

408

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 168-307 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809159.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	168	307	2.1e-25	90.2	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953176.1
ATGGTGGGAGGAGTTTCTAGTGCGAGAGGTTTACGTGGGAGAGGAGGAGGTTCTGGTGGTAGTAGGGGTGCTCCATCATCCTCAAACCCTACATCATCCACAGGATCAGATGGAGGGATTGCTGTATCTGTACGGGATATACAGCTGACTCATTCACCTTCAGCTTCGGATTCGGTTCCTACTGCGACATCAGAGGCTCCCACCACTGGACGTACTACACTCATCATACGACATGGCCAATTACATCCCTTGGGGATGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023632
ATGGTGGGAGGAGTTTCTAGTGCGAGAGGTTTACGTGGGAGAGGAGGAGGTTCTGGTGGTAGTAGGGGTGCTCCATCATCCTCAAACCCTACATCATCCACAGGATCAGATGGAGGGATTGCTGTATCTGTACGGGATATACAGCTGACTCATTCACCTTCAGCTTCGGATTCGGTTCCTACTGCGACATCAGAGGCTCCCACCACTGGACGTACTACACTCATCATACGACATGGCCAATTACATCCCTTGGGGATGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809159.1
MVGGVSSARGLRGRGGGSGGSRGAPSSSNPTSSTGSDGGIAVSVRDIQLTHSPSASDSVPTATSEAPTTGRTTLIIRHGQLHPLGMVPGTVTKIFKQVQNPEGFNWKLTPPAIKTSYFQEFKKHFTWDPAIEADVYKLWLEVAARRYKDFVFDIKKKKNDKRPSFIHEEVWPNWLKYWDSDEFKAKSEIAKKCRMSEPLGPGTGQVKHKGGSRSILQYAEDVAKRKGVEPTDCFYDAYEILHKNKDGTYTDEKSRQIGEK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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