当前解析结果
SmilChr04G003837| 统一新 Gene ID | SmilChr04G003837 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G003837 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G003837 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 54404811 - 54405789 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131023633 |
|---|---|
| GeneID | 131023633 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023633 |
| 原始查询 | LOC131023633 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023633 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057809160.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057809160.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057809160.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057809160.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057809160.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:54404811 |
TCA |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 7 | B127,B134,B18,B66,C34,C47,C73 |
Chr4:54404950 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C20 |
Chr4:54404979 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B137,B7 |
Chr4:54404981 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B44,C20 |
Chr4:54405000 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B7 |
Chr4:54405003 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B30,C37,D4 |
Chr4:54405008 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B16,C43 |
Chr4:54405011 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B77,C17,C75 |
Chr4:54405015 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A18,C40,C6 |
Chr4:54405020 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A3,B20 |
Chr4:54405026 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C48,C5 |
Chr4:54405042 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 6 | B11,B2,B24,B64,C4,D2 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。