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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003908`

染色体: Chr04 坐标: 54830072-54830893 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003908`
名称	SmilChr04G003908
描述	uncharacterized SmilChr04G003908
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	54830072 - 54830893 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023638`
GeneID	`131023638`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023638`
原始查询	`LOC131023638`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Calcium-dependent lipid-binding (CaLB domain) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828043]; symbol=AT4G01200; hit=AT4G01200; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Calcium-dependent lipid-binding (CaLB domain) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828043]; symbol=AT4G01200; hit=AT4G01200; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G01200` (AT4G01200) Calcium-dependent lipid-binding (CaLB domain) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828043] identity=47.8; qcov=0.912; evalue=6.13e-67; confidence=high
Rice	`Os01g0659800` - identity=33.7; qcov=1.02; evalue=8.54e-31; confidence=low
GO	GO:0006952 (defense response)
KEGG	-
Pfam	PF00168 (C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023638

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057809166.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809166.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809166.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809166.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809166.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:54830183`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B131,B21,C39,C74
`Chr4:54830252`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B30,C32,C53,C56,C68
`Chr4:54830263`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C31,C33
`Chr4:54830325`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B136,B63,B74,C33,C36,C53
`Chr4:54830379`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B55,B58,C4,C76,D8
`Chr4:54830435`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B55,B74,B95,C36
`Chr4:54830435`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B55,B74,B95,C36
`Chr4:54830451`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B77,B95,C36
`Chr4:54830462`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr4:54830465`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr4:54830658`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,B60,B63
`Chr4:54830673`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B111,B44,B52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809166.1

273 aa

136

273

PF00168 C2 5-98 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809166.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	5	98	8.7e-10	39.5	C2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953183.1
ATGGCGAATCAGATTCTTGAGATCAACCTGATATCCGCCCAGGGTTTGAAGGCGCCGCCCTCTAACTTACGCAAGATGCAAACCTACGCCCTAACCTGGGTCAACCCGGCCGCCAAGCTCCGCACCCGAGTCGACTCGCTCGGCGGCGAAAACCCTACCTGGAACGACAAGTTCCTCTTCCGCGTCTCCGACGAATTCGTCTCGGGCGACACCTCCGCCGTCTCCGTCGAGATCTTCGCCGTCGGCTACATCAAGGATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023638
ATGGCGAATCAGATTCTTGAGATCAACCTGATATCCGCCCAGGGTTTGAAGGCGCCGCCCTCTAACTTACGCAAGATGCAAACCTACGCCCTAACCTGGGTCAACCCGGCCGCCAAGCTCCGCACCCGAGTCGACTCGCTCGGCGGCGAAAACCCTACCTGGAACGACAAGTTCCTCTTCCGCGTCTCCGACGAATTCGTCTCGGGCGACACCTCCGCCGTCTCCGTCGAGATCTTCGCCGTCGGCTACATCAAGGATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809166.1
MANQILEINLISAQGLKAPPSNLRKMQTYALTWVNPAAKLRTRVDSLGGENPTWNDKFLFRVSDEFVSGDTSAVSVEIFAVGYIKDFLIGTVRFLIGTCLAAPRARDPESPTGTPAFTAVQIRRPSGRFLGVLNIAAAVYCSSDYPILEKVPAVSFRELMERKARESRRQRRLSLSLSLSRSDSRRSHQSSGGDSCDLSDADADADSTTSSSSSAASTALKDWNCVRELAGKMKGAKSNGGGLLCGLMVARKIPSCPSNQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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