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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003940`

染色体: Chr04 坐标: 55014641-55015279 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003940`
名称	SmilChr04G003940
描述	uncharacterized SmilChr04G003940
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55014641 - 55015279 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023639`
GeneID	`131023639`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023639`
原始查询	`LOC131023639`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819259]; symbol=AT2G46495; hit=AT2G46495; species=arabidopsis; confidence=low
产物	RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819259]; symbol=AT2G46495; hit=AT2G46495; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G46495` (AT2G46495) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819259] identity=33; qcov=0.915; evalue=1.96e-19; confidence=low
Rice	`-` -
GO	GO:0030247 (polysaccharide binding)
KEGG	-
Pfam	PF13947 (GUB_WAK_bind)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023639

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057809167.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057809167.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809167.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809167.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809167.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55014659`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C64
`Chr4:55014724`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,B124
`Chr4:55014761`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr4:55014829`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C53
`Chr4:55014829`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C53
`Chr4:55014883`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr4:55014985`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C52
`Chr4:55014985`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr4:55015010`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B7
`Chr4:55015057`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B86
`Chr4:55015067`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B66,C1
`Chr4:55015099`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B103,B48,B54,C13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809167.1

212 aa

106

212

GUB_WAK_bind

PF13947 GUB_WAK_bind 23-91 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809167.1`	Pfam	`PF13947`	GUB_WAK_bind	Domain	23	91	7.3e-10	39.8	Wall-associated receptor kinase galacturonan-binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953184.1
ATGAGAATAATTCTTGGCATTTCATTCCTCTTCCTCACAACCTCGTCTTCATCAATCATCCACGCCTGTCCGAATTCAAACTGCGGCGACTTGTTCATCACTTATCCTTTCAAACTGCAGAGCTCGCAAACTGCAGAAGACGGCTGCAGCTACGTCGATCTGCGATGCAACGGCGCCCCCGATTTTGCAACCGCGATGAATCTCCCCAACGGCGGCGGAGATCTCTACGTGCGTAACATCTCCTACGAGTATCCATACAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023639
ATGAGAATAATTCTTGGCATTTCATTCCTCTTCCTCACAACCTCGTCTTCATCAATCATCCACGCCTGTCCGAATTCAAACTGCGGCGACTTGTTCATCACTTATCCTTTCAAACTGCAGAGCTCGCAAACTGCAGAAGACGGCTGCAGCTACGTCGATCTGCGATGCAACGGCGCCCCCGATTTTGCAACCGCGATGAATCTCCCCAACGGCGGCGGAGATCTCTACGTGCGTAACATCTCCTACGAGTATCCATACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809167.1
MRIILGISFLFLTTSSSSIIHACPNSNCGDLFITYPFKLQSSQTAEDGCSYVDLRCNGAPDFATAMNLPNGGGDLYVRNISYEYPYIQLYDPGNCLIGRLIGLNISLSLASSPLEAFAGAKYALYTCPAAAVDVARDGLYRIDCLSNTTNVTVAVDFPPLLGLEGVGCQEIGNYVLPFTSDGFYDDLYLTWDSTSCPACANTGTDVNVACSI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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