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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003968`

染色体: Chr04 坐标: 55156844-55158172 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003968`
名称	SmilChr04G003968
描述	vegetative cell wall protein gp1
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55156844 - 55158172 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023642`
GeneID	`131023642`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023642`
原始查询	`LOC131023642`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vegetative cell wall protein gp1
产物	vegetative cell wall protein gp1
Arabidopsis	`AT1G75260` (AT1G75260) oxidoreductases, acting on NADH or NADPH [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843863] identity=36.5; qcov=0.217; evalue=9.18e-08; confidence=weak
Rice	`Os01g0106600` - identity=37.5; qcov=0.235; evalue=1.47e-07; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023642

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	1.00000	`XP_057809171.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057809171.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057809171.1`
4	Nucleus inner membrane	Nucleus inner membrane	0.20000	`XP_057809171.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809171.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55156858`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B72,D10,D11
`Chr4:55156899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr4:55156909`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	60	A16,A18,A19,A21,A5,B105,B108,B109,B11,B110,B113,B12,B123,B124,B125,B126,B127,B14,B19,B22,B27,B34,B37,B44,B61,B65,B68,B81,B83,B84,B86,B89,B90,B92,B95,B99,C12,C16,C21,C22,C24,C25,C26,C29,C3,C39,C40,C41,C47,C5,C52,C56,C60,C61,C7,C80,C83,C84,C87,D1
`Chr4:55156911`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr4:55156935`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	25	A10,A8,B103,B133,B136,B14,B16,B25,B33,B52,B64,B88,B94,C18,C2,C20,C33,C34,C49,C68,C73,C79,C81,D2,D4
`Chr4:55156936`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr4:55156938`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	25	A10,A8,B103,B133,B136,B14,B16,B25,B33,B52,B64,B88,B94,C18,C2,C20,C33,C34,C49,C68,C73,C79,C81,D2,D4
`Chr4:55156990`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B76,D7
`Chr4:55157033`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B65,C74
`Chr4:55157040`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr4:55157171`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C10,C3,C46
`Chr4:55157214`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B123,B29,C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953188.1
ATGGCAAGCCAGCCGCGCCCACCGTGGTTCCGGTTTTCTTTGGGAAACCGGGCCCCCGCGCCTGCGCCTGCTCCTGCACCTGCGCCTGCCGCGCCAGCGCCAGTGCAAGTGCGTCCTCCATTTCCAATTAGGCCAACCCTAACTCCGCAACCGGCGCCTCCACCACCCCAACAACCGGCGCCACCACCACCACCACCGCGGTCTCCTTCTCCGGCCCCTACTCCGCAACCATCTTCGCCTAGGGCTCAAGTTGCACCACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023642
ATGGCAAGCCAGCCGCGCCCACCGTGGTTCCGGTTTTCTTTGGGAAACCGGGCCCCCGCGCCTGCGCCTGCTCCTGCACCTGCGCCTGCCGCGCCAGCGCCAGTGCAAGTGCGTCCTCCATTTCCAATTAGGCCAACCCTAACTCCGCAACCGGCGCCTCCACCACCCCAACAACCGGCGCCACCACCACCACCACCGCGGTCTCCTTCTCCGGCCCCTACTCCGCAACCATCTTCGCCTAGGGCTCAAGTTGCACCACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809171.1
MASQPRPPWFRFSLGNRAPAPAPAPAPAPAAPAPVQVRPPFPIRPTLTPQPAPPPPQQPAPPPPPPRSPSPAPTPQPSSPRAQVAPPQPATTTTTPNTPPKPSTPPPPSPTVAPPPPRPPVPTPAPAQPRPTIVAPVRPSVAPPAPSPTRPQVIRPSIAAPIRPSIAPPAPSPTRPPAPPPATPPPRSPAITAANPPPAASSRSPKSPIPTPAKTPQPSPPKNQTPTKAPPPSSPPPPHTPTPSPKTIKPLEKAESPKPK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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