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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004025`

染色体: Chr04 坐标: 55502537-55503403 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004025`
名称	SmilChr04G004025
描述	uncharacterized SmilChr04G004025
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55502537 - 55503403 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023647`
GeneID	`131023647`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023647`
原始查询	`LOC131023647`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814794]; symbol=AT2G02650; hit=AT2G02650; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814794]; symbol=AT2G02650; hit=AT2G02650; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT2G02650` (AT2G02650) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814794] identity=24.5; qcov=1.02; evalue=8.85e-19; confidence=weak
Rice	`Os01g0930300` - identity=25.6; qcov=0.962; evalue=1.4e-15; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023647

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057809175.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057809175.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057809175.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809175.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809175.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55502568`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B48,B60,C35
`Chr4:55502586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	22	B105,B117,B122,B123,B14,B18,B2,B31,B44,B72,C11,C14,C2,C22,C28,C41,C5,C67,C69,C85,D2,D7
`Chr4:55502592`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	45	A19,A5,A9,B111,B114,B123,B132,B28,B31,B40,B42,B43,B47,B48,B5,B7,B72,B73,B88,B91,B95,C14,C16,C2,C22,C24,C27,C28,C30,C33,C34,C40,C41,C47,C49,C5,C53,C55,C56,C58,C6,C69,C85,D2,D3
`Chr4:55502613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr4:55502628`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,C35
`Chr4:55502632`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr4:55502671`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr4:55502699`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	27	A14,A20,A25,B110,B120,B124,B132,B29,B38,B39,B61,B79,B94,C13,C36,C41,C43,C47,C54,C55,C56,C58,C59,C65,C70,C9,D1
`Chr4:55502721`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B109,B26,B3,C82,D10
`Chr4:55502728`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B48,B60,C35
`Chr4:55502740`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr4:55502742`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B48,B60,C35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809175.1

288 aa

144

288

RVT_3

PF13456 RVT_3 140-261 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809175.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	140	261	1.4e-17	64.5	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953192.1
ATGGTGGGAGGAGAGTGTGACACTTGCAAGGCGGGGCTCGAAAACCTTTGGCATACGTTCTATCATTGCCCGTTCGCGGAGGAGGTTTGGAGGTGCAGCGGGGTTCAGGCCTTCATAACTGATATCACAGCTCACAGCGAATCTTTCGTGGAGAGCCTGTTCCTAATAATTGGAAGTAGTGATGCTGAGCTCAAAGCTAAAATCTGCATGTTGTTATGGCAGATATGGAGGGATCGAAATGGGGTTATTTGGAAAGGTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023647
ATGGTGGGAGGAGAGTGTGACACTTGCAAGGCGGGGCTCGAAAACCTTTGGCATACGTTCTATCATTGCCCGTTCGCGGAGGAGGTTTGGAGGTGCAGCGGGGTTCAGGCCTTCATAACTGATATCACAGCTCACAGCGAATCTTTCGTGGAGAGCCTGTTCCTAATAATTGGAAGTAGTGATGCTGAGCTCAAAGCTAAAATCTGCATGTTGTTATGGCAGATATGGAGGGATCGAAATGGGGTTATTTGGAAAGGTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809175.1
MVGGECDTCKAGLENLWHTFYHCPFAEEVWRCSGVQAFITDITAHSESFVESLFLIIGSSDAELKAKICMLLWQIWRDRNGVIWKGAIPAPTRSIAAAMESRNDWIMARHKLSHQVPSAAAASTCVGWHPLQPGYVKCGVDVAFFEDLHAMGVGLVLRDHEGHFIMAKTLKVQGLFKVEEGELMGIKEALSWLKELCYNRGWVESDCKLACKAIRSGERNILELGILAAFCREELSSFLDVQICHVKRDRNVIAHCLARA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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