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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004061`

染色体: Chr04 坐标: 55753724-55765094 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004061`
名称	SmilChr04G004061
描述	probable alkaline/neutral invertase B
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55753724 - 55765094 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023649`
GeneID	`131023649`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023649`
原始查询	`LOC131023649`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable alkaline/neutral invertase B
产物	probable alkaline/neutral invertase B
Arabidopsis	`AT4G34860` (A/N-InvB) Plant neutral invertase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829638] identity=32.5; qcov=0.88; evalue=1.09e-46; confidence=low
Rice	`Os04g0432400` (OsNIN7) - identity=32.1; qcov=0.898; evalue=3.82e-44; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0004575 (sucrose alpha-glucosidase activity); GO:0005987 (sucrose catabolic process); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0033926 (endo-alpha-N-acetylgalactosaminidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF12899 (Glyco_hydro_100)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023649

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057809176.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057809176.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809176.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809176.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809176.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55753730`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A3,A5,B12,B16,C36,C45,C61,C72,C78
`Chr4:55753948`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:55753984`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A3,A5,B12,B16,C36,C45,C61,C72
`Chr4:55754047`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B135
`Chr4:55754047`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B135
`Chr4:55757071`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	131	A1,A10,A11,A13,A20,A21,A24,A25,A5,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B104,B105,B107,B108,B109,B11,B113,B117,B118,B12,B120,B121,B122,B126,B127,B129,B13,B130,B131,B132,B134,B136,B14,B140,B15,B18,B23,B26,B3,B30,B31,B32,B35,B38,B4,B41,B42,B43,B47,B49,B50,B54,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B69,B7,B71,B72,B73,B76,B77,B78,B83,B86,B88,B9,B91,B95,B98,C1,C11,C13,C14,C18,C19,C2,C21,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C34,C35,C39,C42,C43,C45,C47,C5,C51,C53,C55,C56,C57,C59,C65,C67,C69,C7,C73,C74,C75,C78,C79,C8,C81,C83,C86,C87,C9,D1,D3,D6,D7,D8,D9
`Chr4:55757093`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	93	A1,A10,A11,A20,A21,A24,A8,A9,B100,B101,B102,B104,B105,B107,B109,B11,B117,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B126,B129,B13,B130,B131,B132,B136,B14,B140,B15,B18,B23,B26,B30,B32,B35,B38,B4,B47,B50,B54,B57,B60,B61,B63,B64,B69,B71,B76,B77,B78,B82,B88,B9,B91,B95,C11,C13,C14,C18,C2,C21,C24,C25,C26,C27,C28,C34,C39,C42,C45,C5,C53,C55,C56,C57,C69,C7,C73,C74,C78,C8,C83,C86,C9,D1,D3,D6,D7,D8
`Chr4:55757150`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B97,C55
`Chr4:55757170`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr4:55757171`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B117,B4,B44,B97,C55
`Chr4:55757172`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C22,C41,C48,C54
`Chr4:55757194`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B134

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809176.1

433 aa

216

433

Glyco_hydro_100

PF12899 Glyco_hydro_100 2-113 aa PF12899 Glyco_hydro_100 237-355 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809176.1`	Pfam	`PF12899`	Glyco_hydro_100	Repeat	2	113	1.5e-55	189.4	Alkaline and neutral invertase
`XP_057809176.1`	Pfam	`PF12899`	Glyco_hydro_100	Repeat	237	355	1.5e-55	189.4	Alkaline and neutral invertase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953193.1
ATGACAGTATTCTTGAGGGATTTTGTCCCCGTTGGACTGGCACTCTTGATGTCAAGTGGTGATGATGATAAATGTGATTTGAACATTGTGAAAACATTTCTATTGACGAGTCTTGAACTTTCACGAAATGGTGTGTTTTGTCATAGTTTCAGACTCACAGTTGACACCATTGACCCAGGATACGAGAACTTAGAAGCTGATTTCGGGTCGGACGTTCCCATAGACAGTGGCCTATGGTGGACCGTGCTTCTGTACGCATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023649
ATGACAGTATTCTTGAGGGATTTTGTCCCCGTTGGACTGGCACTCTTGATGTCAAGTGGTGATGATGATAAATGTGATTTGAACATTGTGAAAACATTTCTATTGACGAGTCTTGAACTTTCACGAAATGGTGTGTTTTGTCATAGTTTCAGACTCACAGTTGACACCATTGACCCAGGATACGAGAACTTAGAAGCTGATTTCGGGTCGGACGTTCCCATAGACAGTGGCCTATGGTGGACCGTGCTTCTGTACGCATA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809176.1
MTVFLRDFVPVGLALLMSSGDDDKCDLNIVKTFLLTSLELSRNGVFCHSFRLTVDTIDPGYENLEADFGSDVPIDSGLWWTVLLYAYTMKSKDLTVSMLPQVQLAIKKVFTLFRLDELIAEHVPQWVSLGAAGYFLGNSCPTGCIKVNKGDIASEAIKLLEAHLYQYKWPEYYEGEAIKLLEAHLYQDKWPEYYEGETVQVFLRDLSSGDDDKCDLNIVKTFLLTSLELSRNVRLDELIAEHVPQWVSLGAAGYFLGNSC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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