当前解析结果
SmilChr04G000060| 统一新 Gene ID | SmilChr04G000060 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G000060 |
| 描述 | villin-3-like |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 548468 - 551553 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131023660 |
|---|---|
| GeneID | 131023660 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023660 |
| 原始查询 | LOC131023660 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | villin-3-like |
| 产物 | villin-3-like |
| Arabidopsis | AT3G57410 (VLN3)villin 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824908] identity=60.3; qcov=0.872; evalue=1.21e-19; confidence=low |
| Rice | Os03g0356700 (VLN2)- identity=71.1; qcov=0.577; evalue=3.54e-16; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023660 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057809185.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057809184.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057809184.1 |
| 4 | Chloroplast thylakoid | 类囊体 | 0.40000 | XP_057809185.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057809184.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:549799 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B136,B80,C16,C74 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
12 records
下载 cDNA FASTA4 records
下载 CDS FASTA4 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。