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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001209`

染色体: Chr04 坐标: 18725288-18726659 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001209`
名称	SmilChr04G001209
描述	mitogen-activated protein kinase kinase kinase 18-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	18725288 - 18726659 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023671`
GeneID	`131023671`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023671`
原始查询	`LOC131023671`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitogen-activated protein kinase kinase kinase 18-like
产物	mitogen-activated protein kinase kinase kinase 18-like
Arabidopsis	`AT5G55090` (MAPKKK15) mitogen-activated protein kinase kinase kinase 15 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835600] identity=41.2; qcov=0.959; evalue=3.68e-72; confidence=medium
Rice	`Os02g0322400` - identity=44.6; qcov=0.798; evalue=3.58e-73; confidence=medium
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF03109 (ABC1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023671

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809203.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057809203.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057809203.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809203.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809203.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:18725661`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr4:18725709`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr4:18725754`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B73,C9
`Chr4:18725754`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B73,C9
`Chr4:18725756`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B73,C9
`Chr4:18725756`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B73,C9
`Chr4:18725759`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B73,C9
`Chr4:18725759`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B73,C9
`Chr4:18725761`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B73,C9
`Chr4:18725761`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B73,C9
`Chr4:18725807`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B139,B98,C18,C22,C44
`Chr4:18725922`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B98,C18,C44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809203.1

362 aa

181

362

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

ABC1

PF00069 Pkinase 45-294 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 46-287 aa PF03109 ABC1 113-192 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809203.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	45	294	1.8e-60	205.3	Protein kinase domain
`XP_057809203.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	46	287	3.5e-37	128.8	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057809203.1`	Pfam	`PF03109`	ABC1	Domain	113	192	4e-05	23.6	ABC1 atypical kinase-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953220.1
GGTTAAATATAATTTGTGAGCTTCCAATCCAAGTTTTTGTTGATGAGAGCGGTGTTCCATTCTGTGGAAGCCGCTCTTGAATTTGAAGCTATGGAAGGCGAGTTGAAACAAGCACAAGAGCTGAGTTATTTGGAAGACATGAGAGGCAAATGGCAATGCTGCGAGTGGCTCAAGGGCGACGTGATCGGATCGGGATCCTTCGGCACCGTGAACCTCGCCATCGACACCACCACCGGCTCCCTCTTCGTCGTCAAATCCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023671
ATGAGAGCGGTGTTCCATTCTGTGGAAGCCGCTCTTGAATTTGAAGCTATGGAAGGCGAGTTGAAACAAGCACAAGAGCTGAGTTATTTGGAAGACATGAGAGGCAAATGGCAATGCTGCGAGTGGCTCAAGGGCGACGTGATCGGATCGGGATCCTTCGGCACCGTGAACCTCGCCATCGACACCACCACCGGCTCCCTCTTCGTCGTCAAATCCGCCACCACCGAGGCCGGCATCGCCTCCCTCAAGAACGAGGCCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809203.1
MRAVFHSVEAALEFEAMEGELKQAQELSYLEDMRGKWQCCEWLKGDVIGSGSFGTVNLAIDTTTGSLFVVKSATTEAGIASLKNEADILHNLDSPYIVKCMGKDGGDAGKCSLFFEYMGGGSISDMMQKFGGALQEKVIRLYTRQILLGLNYLHRNGIVHSDIKCNNVLVGASGTVKLTDFGCAKRKKNHCKGTIGGTPLWMAPEVLRDQSLDFAADIWSLGCTVIEMATGRPPWPCGEHNNPMAAMLRISQGDDLPDFP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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