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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001256`

染色体: Chr04 坐标: 19815050-19817760 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001256`
名称	SmilChr04G001256
描述	DNA repair protein RAD50-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	19815050 - 19817760 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023705`
GeneID	`131023705`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023705`
原始查询	`LOC131023705`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA repair protein RAD50-like
产物	DNA repair protein RAD50-like
Arabidopsis	`AT2G31970` (RAD50) DNA repair-recombination protein (RAD50) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817756] identity=91.5; qcov=0.67; evalue=1.2e-31; confidence=medium
Rice	`Os02g0497500` (Rad50) - identity=89.8; qcov=0.67; evalue=1.47e-31; confidence=medium
GO	GO:0000722 (telomere maintenance via recombination); GO:0000794 (condensed nuclear chromosome); GO:0003691 (double-stranded telomeric DNA binding); GO:0006302 (double-strand break repair); GO:0007004 (telomere maintenance via telomerase); GO:0030870 (Mre11 complex); GO:0032508 (GO:0032508); GO:0043047 (single-stranded telomeric DNA binding); GO:0051880 (G-quadruplex DNA binding); GO:0070192 (chromosome organization involved in meiotic cell cycle); GO:0090305 (GO:0090305)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023705

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057809260.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057809261.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057809261.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057809260.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809260.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:19815263`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,C75
`Chr4:19815267`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B114,C30
`Chr4:19815267`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B114,C30
`Chr4:19815272`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B3,B4,B54,C12,C15,C21,C42
`Chr4:19815293`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	27	A1,A10,A24,A3,A9,B122,B127,B135,B14,B25,B29,B6,B63,B65,B69,B80,C17,C19,C33,C41,C51,C60,C67,C80,C84,C87,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009101492.1
AAATATTTCACTAATTAAAATACTTACAACACACGACTGTCTTCTTCCTCCCACTTCGAATTTCACTCAAACCCACAATATTTCTCTATTGCGTGAAATACCCAAATTTCGATTTCACTCATATCTCGCCGCTGCTGCGCCACCAATATCCCGCAGGCCGCTGCTGCGCCGTCGTCTCTGTTTTGCATTTTTTGGGGAATTTGAATTTTGCCCTAACCGCTCACAGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCGCGGCGTGCAGT...

XM_057953278.1
CTAATTAAAATACTTACAACACACGACTGTCTTCTTCCTCCCACTTCGAATTTCACTCAAACCCACAATATTTCTCTATTGCGTGAAATACCCAAATTTCGATTTCACTCATATCTCGCCGCTGCTGCGCCACCAATATCCCGCAGGCCGCTGCTGCGCCGTCGTCTCTGTTTTGCATTTTTTGGGGAATTTGAATTTTGCCCTAACCGCTCACAGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCGCGGCGTGCAGTTCAATCCGTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131023705
ATGTATTCTAGTTCAATGTTGCTTAATGTGTTAATGCAAACTGGTGATGCACAACTAGAAATGAGAGGAAGGTGTAGTGTCGGTCAAAAGGTTCTTGCTTCACTTATCATAAGATTGGCAGTAGCGGAAACCTTTTGCCTTAATGGCGGAATACTTGCACTGGATGAACCAACCACAAACTTGGATGGCCCCAACTCTGAGTCTTGTAACAGCTTTACTTATGGGTCCAACCTATGGTTACAGGGGAAAGGTGTTGCTTG...

LOC131023705
ATGTATTCTAGTTCAATGTTGCTTAATGTATATTTGGTGTTAATGCAAACTGGTGATGCACAACTAGAAATGAGAGGAAGGTGTAGTGTCGGTCAAAAGGTTCTTGCTTCACTTATCATAAGATTGGCAGTAGCGGAAACCTTTTGCCTTAATGGCGGAATACTTGCACTGGATGAACCAACCACAAACTTGGATGGCCCCAACTCTGAGTCTTGTAACAGCTTTACTTATGGGTCCAACCTATGGTTACAGGGGAAAGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057809260.1
MYSSSMLLNVYLVLMQTGDAQLEMRGRCSVGQKVLASLIIRLAVAETFCLNGGILALDEPTTNLDGPNSESCNSFTYGSNLWLQGKGVACF

XP_057809261.1
MYSSSMLLNVLMQTGDAQLEMRGRCSVGQKVLASLIIRLAVAETFCLNGGILALDEPTTNLDGPNSESCNSFTYGSNLWLQGKGVACF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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