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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000058`

染色体: Chr04 坐标: 526138-528555 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000058`
名称	SmilChr04G000058
描述	squamosa promoter-binding-like protein 8
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	526138 - 528555 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023724`
GeneID	`131023724`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023724`
原始查询	`LOC131023724`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	squamosa promoter-binding-like protein 8
产物	squamosa promoter-binding-like protein 8
Arabidopsis	`AT1G02065` (SPL8) squamosa promoter binding protein-like 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839275] identity=49.9; qcov=1.06; evalue=2.9e-86; confidence=high
Rice	`Os06g0659100` (OsSPL10) - identity=62.6; qcov=0.37; evalue=3.58e-42; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0005634 (nucleus)
KEGG	-
Pfam	PF03110 (SBP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023724

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809269.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809269.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809269.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809269.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057809269.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:526900`	`GTT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	28	A2,A8,B10,B100,B115,B120,B140,B41,B46,B53,B59,B60,B69,B7,B83,C21,C25,C33,C34,C35,C46,C50,C58,C70,C72,C78,C8,C80
`Chr4:526903`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	127	A10,A13,A19,A22,A3,A5,A6,A9,B1,B10,B102,B104,B105,B108,B109,B111,B112,B113,B115,B125,B127,B129,B13,B130,B131,B132,B134,B135,B137,B138,B15,B16,B18,B19,B2,B21,B22,B25,B26,B27,B30,B31,B33,B37,B4,B41,B42,B43,B46,B48,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B6,B61,B62,B64,B66,B68,B70,B74,B75,B77,B78,B79,B80,B81,B84,B86,B87,B88,B91,B94,B95,B97,B98,C11,C16,C17,C18,C19,C20,C22,C31,C34,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C44,C47,C49,C51,C53,C55,C56,C57,C58,C6,C61,C64,C65,C66,C67,C69,C71,C73,C74,C75,C82,C83,C84,C86,D10,D11,D2,D4,D5,D7,D8,D9
`Chr4:526936`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	102	A13,A18,A19,A2,A22,A23,A25,A9,B1,B100,B105,B106,B109,B112,B122,B123,B124,B127,B128,B13,B130,B131,B135,B136,B137,B138,B14,B16,B17,B19,B21,B22,B23,B24,B27,B3,B31,B32,B33,B34,B37,B38,B39,B40,B44,B54,B57,B58,B61,B62,B65,B67,B70,B72,B73,B75,B78,B79,B81,B86,B89,B94,B97,C1,C10,C11,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C23,C24,C25,C27,C28,C29,C3,C31,C35,C36,C38,C39,C42,C47,C48,C52,C56,C60,C69,C73,C78,C8,D3,D5,D6,D7,D8
`Chr4:526952`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	60	A11,A13,A14,A19,A2,A21,A23,A25,A7,B100,B105,B106,B109,B112,B118,B122,B124,B127,B128,B135,B136,B16,B22,B23,B3,B33,B38,B39,B40,B44,B45,B65,B75,B76,B94,C10,C11,C12,C13,C14,C16,C17,C2,C20,C23,C29,C3,C30,C36,C38,C39,C48,C52,C60,C69,C7,C73,C78,C85,D3
`Chr4:527095`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,C52
`Chr4:527197`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,C57
`Chr4:527980`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B18,C80
`Chr4:528226`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809269.1

375 aa

188

375

SBP

PF03110 SBP 226-299 aa

XP_057809270.1

311 aa

156

311

SBP

PF03110 SBP 162-235 aa

XP_057809271.1

311 aa

156

311

SBP

PF03110 SBP 162-235 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809269.1`	Pfam	`PF03110`	SBP	Domain	226	299	2.1e-31	108.7	SBP domain
`XP_057809270.1`	Pfam	`PF03110`	SBP	Domain	162	235	1.7e-31	109.0	SBP domain
`XP_057809271.1`	Pfam	`PF03110`	SBP	Domain	162	235	1.7e-31	109.0	SBP domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953286.1
AAGCCGCCTCACACAAGTCAGCAGGTTGCCGAGCTTTCTCTCACACACAGCAAGAGGGGAAAAAGTAACACCGCTGTCCCTCCCAATTTTAGAGCGAGAGAGAATTATTGGTTGAAAGAGATGCCAATTATAGAGAGAGAAAGAGCAGTTTGTGTTGTCCTTGCCAAGATTAATGGAGAAACACTAGCTTCTATATTTACTACCAAACGAGTTATTGAAATCGGCTTCCAAAAAGATTCAACAGTGAAGTGGGGTTTGTT...

XM_057953287.1
GAGAGAAAGAGCAGTTTGTGTTGTCCTTGCCAAGATTAATGGAGAAACACTAGCTTCTATATTTACTACCAAAGTAGGTTTTTGATTTACCATCCATAATGTTTGTTTGTTGTATGCCTCTCTCACTTTCCACACTAGAAGCGAGTTATTGAAATCGGCTTCCAAAAAGATTCAACAGTGAAGTGGGGTTTGTTTGAGAGAGAGAGAGAGAGATATAGGTTGCGTTATAGAGAGAGAGAGAGAGAAATGTTGGACTATGG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131023724
ATGCCAATTATAGAGAGAGAAAGAGCAGTTTGTGTTGTCCTTGCCAAGATTAATGGAGAAACACTAGCTTCTATATTTACTACCAAACGAGTTATTGAAATCGGCTTCCAAAAAGATTCAACAGTGAAGTGGGGTTTGTTTGAGAGAGAGAGAGAGAGATATAGGTTGCGTTATAGAGAGAGAGAGAGAGAAATGTTGGACTATGGATGGGGCAACCCATCATCGATCATGCTCTCTGGCGACGAAACCGGTCAAGATTC...

LOC131023724
ATGTTGGACTATGGATGGGGCAACCCATCATCGATCATGCTCTCTGGCGACGAAACCGGTCAAGATTCCGAACCGAACCGCCCGGTTTTCGACCCTTACTCCTCCCAAAGCTTCTCCGACGCCGCCAGCTTCGCCAACCCGGACAACCACTTCGCCGCCGCGGCGGCGCACCACCACCACCTCCCCTTCCACACGCCCCAAACCCCGAGCTCCAACGCCCACTTCACGAGCTTCTACGGCGGCGGCGCCGCCCCATACCC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057809269.1
MPIIERERAVCVVLAKINGETLASIFTTKRVIEIGFQKDSTVKWGLFERERERYRLRYREREREMLDYGWGNPSSIMLSGDETGQDSEPNRPVFDPYSSQSFSDAASFANPDNHFAAAAAHHHHLPFHTPQTPSSNAHFTSFYGGGAAPYPNPASMLTLEPAAAYSVVPKSEPMVGGFEFNAEYNSRIGLNLGGRTYFASSEDDFVNRLYRRSRILEPGSVNSPRCQAEGCNADLTHAKHYHRRHKVCEFHSKAATVIAA...

XP_057809270.1
MLDYGWGNPSSIMLSGDETGQDSEPNRPVFDPYSSQSFSDAASFANPDNHFAAAAAHHHHLPFHTPQTPSSNAHFTSFYGGGAAPYPNPASMLTLEPAAAYSVVPKSEPMVGGFEFNAEYNSRIGLNLGGRTYFASSEDDFVNRLYRRSRILEPGSVNSPRCQAEGCNADLTHAKHYHRRHKVCEFHSKAATVIAAGLTQRFCQQCSRFHLLSEFDNGKRSCRKRLADHNRRRRKSQQTNQDKSHAEITAASENLARSPP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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