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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003180`

染色体: Chr04 坐标: 48515885-48517622 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003180`
名称	SmilChr04G003180
描述	zinc finger CCCH domain-containing protein 14-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	48515885 - 48517622 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023725`
GeneID	`131023725`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023725`
原始查询	`LOC131023725`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger CCCH domain-containing protein 14-like
产物	zinc finger CCCH domain-containing protein 14-like
Arabidopsis	`AT1G66810` (AT1G66810) Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842999] identity=44.5; qcov=0.909; evalue=1.37e-70; confidence=medium
Rice	`Os05g0576300` (OsC3H39) - identity=43.7; qcov=0.947; evalue=1.02e-68; confidence=medium
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00642 (zf-CCCH); PF18044 (zf-CCCH_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023725

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057809272.1`
2	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.60000	`XP_057809272.1`
3	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.40000	`XP_057809272.1`
4	P-body	P-body	0.40000	`XP_057809272.1`
5	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057809272.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:48516268`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B17,B23,B57,C71
`Chr4:48517031`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr4:48517080`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr4:48517130`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr4:48517323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809272.1

319 aa

160

319

zf-CCCH

zf-CCCH_4

PF00642 zf-CCCH 242-266 aa PF18044 zf-CCCH_4 245-265 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809272.1`	Pfam	`PF00642`	zf-CCCH	Family	242	266	1.3e-16	60.7	Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type (and similar)
`XP_057809272.1`	Pfam	`PF18044`	zf-CCCH_4	Domain	245	265	1.9e-10	40.9	CCCH-type zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953289.1
ACTGCTTTCTGTTCCTATATAATTTTAATCCTTTTCTTCTCTTTCTCAATCTCAATTACTCCAACTATTTCAACATTTTTTTTTGAAATGCAGAGAGAGGATATTTCATATGATTCTCTTATCGCCACCTCCGCAGGAGATAAATCCGCGGCGGCGTCACTGCTTTTCTCCTACAGCAATCCGTTCCTTTCCCCAACGTCACCAACCTACGTGAACTCCGACGCCTCCTTCTATTCCTCGCTCTTTCAGAACTACTCATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023725
ATGCAGAGAGAGGATATTTCATATGATTCTCTTATCGCCACCTCCGCAGGAGATAAATCCGCGGCGGCGTCACTGCTTTTCTCCTACAGCAATCCGTTCCTTTCCCCAACGTCACCAACCTACGTGAACTCCGACGCCTCCTTCTATTCCTCGCTCTTTCAGAACTACTCATCAAACTCTGCCTCCGATACCGCCTCTTTCGATGGCAGCGACACCGATCGCCGCCTCCAGGATGCGAGCTGCGTCATGGAGTATCAGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809272.1
MQREDISYDSLIATSAGDKSAAASLLFSYSNPFLSPTSPTYVNSDASFYSSLFQNYSSNSASDTASFDGSDTDRRLQDASCVMEYQQLYNRYTLCLAQLHDSIEEADALRRDNESLRLSNADLSHRIALLFSRDRLLSDFNRLNVASPSVAVPRAAHLTATQPLAEHNRVERRNTERVTLPKSISVRTSGYLKMTRPGRDTAGDKAVSQPTAALREQQRVYVGGSTKENGEELDVYNQGMTKTELCNKWQETGACPYGEN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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