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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003203`

染色体: Chr04 坐标: 48862476-48867047 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003203`
名称	SmilChr04G003203
描述	la-related protein 1B-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	48862476 - 48867047 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023726`
GeneID	`131023726`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023726`
原始查询	`LOC131023726`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	la-related protein 1B-like
产物	la-related protein 1B-like
Arabidopsis	`AT4G35890` (LARP1c) winged-helix DNA-binding transcription factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829743] identity=31.6; qcov=0.866; evalue=3.17e-39; confidence=low
Rice	`Os03g0156500` - identity=41.6; qcov=0.36; evalue=7.82e-30; confidence=low
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF05383 (La)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023726

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057809273.1`
2	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	1.00000	`XP_057809273.1`
3	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.80000	`XP_057809273.1`
4	P-body	P-body	0.40000	`XP_057809273.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057809273.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:48862788`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,C54
`Chr4:48862796`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr4:48862851`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B5,C61,C83
`Chr4:48862851`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B5,C61,C83
`Chr4:48862965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr4:48862980`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C69
`Chr4:48862981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr4:48862983`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B44,C2,C32,C68
`Chr4:48863034`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B56,B73,B96,C3,C40
`Chr4:48863060`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr4:48863100`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr4:48863142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809273.1

461 aa

230

461

PF05383 La 349-404 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809273.1`	Pfam	`PF05383`	La	Domain	349	404	3.7e-20	72.3	La domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953290.1
ACAGAAACCTAGGTGGGGGAAGGGAGGTAGTAATACTCAATTTTCACAATTGTGATTTTGGTTTCCGATCGGAAACCAAACCCCATTTTTTGGAATTTGTTTACGATCATCATCTAGATTTAATTTTTATTTTATTTTTTTTCAATTTTTTCTGAGACATAGATTAGTCAGGTCGAATAATTTGTTGATTTTTAGCCCTTCGAGAAATTGGATTCGCATACTGTTGTTTGAGGAGCTTGATTTCCTAAAAGCATCGAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023726
ATGGCAGCGGCGTCGAAGTCTCCTTCTACGCTTGTTCAAGCTCATAATTCTCGCCAGTCCCGGTGGCCCTTGGCGGCACGTGGCGTGCATTCGCCTCCTTATCAAATTGTCGATCAGGAACAGTCTGTAACTTCATGTCTTACTATCCCTCACAGCAAAATAGTGGATGCATTTAATTCTTTGGTTGCATATGAATCTGCTGCTGGCGTGGATGATCAGGTCGAAAACAGTGAAAATGGTGGCGCAGAGAAGAAGCCGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809273.1
MAAASKSPSTLVQAHNSRQSRWPLAARGVHSPPYQIVDQEQSVTSCLTIPHSKIVDAFNSLVAYESAAGVDDQVENSENGGAEKKPVWNKPSSGAAAVAAEVGTVMGAEAWPALSDTARGSPKSPFVSSNGSIIIPEGVLPGSLSPRKGPDTSISTQIHMAPGGQRSTKSGGDSPNHNRMAANGSLSQAPFAESQQQNAGNSVTSAREYNKEEAAHWVSGQRGRSFGGNELHAQHGPFRGNSGPQARPDGSYHHRHGGRR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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