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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002919`

染色体: Chr04 坐标: 45418786-45420645 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002919`
名称	SmilChr04G002919
描述	glutathione S-transferase F11-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	45418786 - 45420645 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023733`
GeneID	`131023733`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023733`
原始查询	`LOC131023733`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glutathione S-transferase F11-like
产物	glutathione S-transferase F11-like
Arabidopsis	`AT3G03190` (GSTF11) glutathione S-transferase F11 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821227] identity=49.7; qcov=0.855; evalue=1.92e-49; confidence=medium
Rice	`Os03g0135300` (OsGSTF3) - identity=40.8; qcov=0.884; evalue=1.35e-38; confidence=medium
GO	GO:0004364 (glutathione transferase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0043295 (glutathione binding)
KEGG	smil00480 (Glutathione metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00043 (GST_C); PF02798 (GST_N); PF13409 (GST_N_2); PF13410 (GST_C_2); PF13417 (GST_N_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023733

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057809279.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057809280.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057809280.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809279.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809279.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:45419064`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr4:45420054`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	99	A1,A10,A11,A13,A15,A18,A2,A20,A22,A23,A24,A6,A8,B1,B101,B103,B104,B106,B107,B110,B111,B117,B120,B127,B128,B13,B130,B132,B14,B140,B19,B2,B21,B22,B23,B26,B28,B3,B31,B37,B38,B39,B40,B42,B43,B46,B5,B56,B58,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B73,B76,B77,B8,B80,B84,B85,B87,B88,B9,B91,B95,B96,B97,B99,C1,C13,C16,C2,C23,C3,C32,C35,C36,C38,C39,C41,C44,C50,C51,C53,C57,C61,C62,C63,C64,C66,C67,C68,C7,C83,C87,C9,D2
`Chr4:45420222`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr4:45420492`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D4
`Chr4:45420492`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D4
`Chr4:45420494`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D4
`Chr4:45420494`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809279.1

214 aa

107

214

GST_N

GST_N_3

GST_N_2

GST_C

GST_C_2

PF02798 GST_N 1-73 aa PF13417 GST_N_3 10-73 aa PF13409 GST_N_2 13-75 aa PF00043 GST_C 119-204 aa PF13410 GST_C_2 135-196 aa

XP_057809280.1

172 aa

172

GST_C

GST_C_2

PF00043 GST_C 76-162 aa PF13410 GST_C_2 93-154 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809279.1`	Pfam	`PF02798`	GST_N	Domain	1	73	7.4e-18	65.4	Glutathione S-transferase, N-terminal domain
`XP_057809279.1`	Pfam	`PF13417`	GST_N_3	Domain	10	73	5e-10	40.3	Glutathione S-transferase, N-terminal domain
`XP_057809279.1`	Pfam	`PF13409`	GST_N_2	Domain	13	75	2e-10	41.9	Glutathione S-transferase, N-terminal domain
`XP_057809279.1`	Pfam	`PF00043`	GST_C	Domain	119	204	2.7e-10	41.1	Glutathione S-transferase, C-terminal domain
`XP_057809279.1`	Pfam	`PF13410`	GST_C_2	Domain	135	196	1.1e-06	29.3	Glutathione S-transferase, C-terminal domain
`XP_057809280.1`	Pfam	`PF00043`	GST_C	Domain	76	162	1.8e-10	41.6	Glutathione S-transferase, C-terminal domain
`XP_057809280.1`	Pfam	`PF13410`	GST_C_2	Domain	93	154	7.4e-07	29.9	Glutathione S-transferase, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953296.1
GTGCAACCAACCAATATGAGGATAACCACCCCAACCCCAACCCCCACCCGCTTCCTCTATATATGGCGAAAATTGGACTTATATTTTGGTAGCTAGAAATTGCGAAGCATTTCATTGCATCAAATATAGAAATACTTTTCTAAGCTTAATTCATTGTGCAAAATGGTGGTTAAAGTGTATGGTGCGACCTATGCAGCTTGCCCACAAAGGGTTTTGACTTGCCTTTTTGAGTTAGGCTTTCAATTTGAGCTTGTACCAAT...

XM_057953297.1
TGGTAGCTAGAAATTGCGAAGCATTTCATTGCATCAAATATAGAAATACTTTTCTAAGCTTAATTCATTGTGCAAAATGGTGGTTAAAGTGTATGGTGCGACCTATGCAGCTTGCCCACAAAGGGTTTTGACTTGCCTTTTTGAGTTAGGCTTTCAATTTGAGCTTGTACCAATTGATCTTCAATCAGCAGAGCAGAAAAAGCCACAATTTCTATTAAGACAGGTGATTCTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTAATGATAGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131023733
ATGGTGGTTAAAGTGTATGGTGCGACCTATGCAGCTTGCCCACAAAGGGTTTTGACTTGCCTTTTTGAGTTAGGCTTTCAATTTGAGCTTGTACCAATTGATCTTCAATCAGCAGAGCAGAAAAAGCCACAATTTCTATTAAGACAGCCCTTCGGACAAGTTCCTGCGATAGAGGATGGAGATTTCAAACTCTTCGAGTCGAGGGCAATAATCAGGTACTACGCAGCAAAAAGCATAAGCCAAGGTGGCACAAATATATT...

LOC131023733
ATGGAGATTTCAAACTCTTCGCGCAAAAATAAACATAAATTTTGGGTTACAAAATCCATTGGGAGCGCAGAGTCGAGGGCAATAATCAGGTACTACGCAGCAAAAAGCATAAGCCAAGGTGGCACAAATATATTGGGCGACACATTGGAAGAGAGAGCCTTGGTGGAGCAATGGGTGGAAGTAGAAGTGAACAACTATAATCCATTGATTTACACAATGGTCCTCCAACTTGTGATATTGCCCCAACAGGGACAAGTGGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057809279.1
MVVKVYGATYAACPQRVLTCLFELGFQFELVPIDLQSAEQKKPQFLLRQPFGQVPAIEDGDFKLFESRAIIRYYAAKSISQGGTNILGDTLEERALVEQWVEVEVNNYNPLIYTMVLQLVILPQQGQVGDMELVRDCKGKLEKVLDVYEDRLSKSKYLGGERFTIADMTHLPNTRFLMEEGGMEDLIKRRKNLHNWWIDISSRPSWQKVMDLRN

XP_057809280.1
MEISNSSRKNKHKFWVTKSIGSAESRAIIRYYAAKSISQGGTNILGDTLEERALVEQWVEVEVNNYNPLIYTMVLQLVILPQQGQVGDMELVRDCKGKLEKVLDVYEDRLSKSKYLGGERFTIADMTHLPNTRFLMEEGGMEDLIKRRKNLHNWWIDISSRPSWQKVMDLRN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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