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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002922`

染色体: Chr04 坐标: 45478991-45483499 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002922`
名称	SmilChr04G002922
描述	ras-related protein RHN1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	45478991 - 45483499 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023737`
GeneID	`131023737`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023737`
原始查询	`LOC131023737`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ras-related protein RHN1-like
产物	ras-related protein RHN1-like
Arabidopsis	`AT4G19640` (ARA7) Ras-related small GTP-binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827706] identity=74.9; qcov=0.806; evalue=7.97e-111; confidence=high
Rice	`Os03g0666500` (OsRab5B1) - identity=76; qcov=0.778; evalue=1.15e-104; confidence=high
GO	GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding)
KEGG	smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04145 (Phagocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04148 (Efferocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00025 (Arf); PF00071 (Ras); PF08477 (Roc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023737

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057809283.1`
2	Vesicle	囊泡	0.60000	`XP_057809283.1`
3	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.40000	`XP_057809283.1`
4	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057809283.1`
5	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.40000	`XP_057809283.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:45479094`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D11
`Chr4:45479094`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D11
`Chr4:45479143`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	35	A14,A15,A21,A23,B12,B123,B136,B14,B15,B20,B33,B40,B44,B5,B61,B63,B69,B70,B76,B9,B94,B95,C14,C17,C21,C24,C29,C33,C39,C47,C5,C61,C65,C80,C83
`Chr4:45482747`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B62
`Chr4:45482747`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B62
`Chr4:45483242`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	78	A18,A21,A4,A7,A9,B100,B105,B106,B108,B111,B113,B117,B12,B120,B134,B140,B16,B20,B25,B26,B33,B35,B4,B40,B45,B46,B48,B49,B51,B52,B53,B55,B59,B60,B65,B68,B70,B74,B77,B78,B79,B82,B9,B97,B98,C10,C16,C19,C23,C27,C30,C31,C33,C35,C36,C39,C44,C45,C46,C48,C5,C52,C53,C54,C60,C65,C70,C72,C74,C77,C78,C80,D2,D3,D6,D7,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809283.1

252 aa

126

252

Arf

Roc

Ras

PF00025 Arf 13-144 aa PF08477 Roc 23-137 aa PF00071 Ras 23-182 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809283.1`	Pfam	`PF00025`	Arf	Domain	13	144	5.1e-13	49.6	ADP-ribosylation factor family
`XP_057809283.1`	Pfam	`PF08477`	Roc	Domain	23	137	8.6e-35	120.3	Ras of Complex, Roc, domain of DAPkinase
`XP_057809283.1`	Pfam	`PF00071`	Ras	Domain	23	182	4.5e-62	209.1	Ras family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953300.1
GATTATTTATTTATTTAGAAGAAAATTTCAAAACAAACTTTTGGAAATGAAGCAAATGTATGAGTTTGACCCGTCATCAGTTGCTTTGGGCTATGGCGAATACGGCTCACAACAACCTCAATGCTAAACTCGTCTTACTTGGAGACATGGGCGCCGGTAAATCGAGCCTTGTGATACGTTTCGTGAAGGGACAATTTCTTGAATTCCAAGAATCAACGATCGGGGCAGCCTTCTTCTCACAGACTGTTTCCGTGAACAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023737
ATGAGTTTGACCCGTCATCAGTTGCTTTGGGCTATGGCGAATACGGCTCACAACAACCTCAATGCTAAACTCGTCTTACTTGGAGACATGGGCGCCGGTAAATCGAGCCTTGTGATACGTTTCGTGAAGGGACAATTTCTTGAATTCCAAGAATCAACGATCGGGGCAGCCTTCTTCTCACAGACTGTTTCCGTGAACAATGCCACTGTGAAGTTTGAGATCTGGGACACTGCTGGGCAGGAGAGGTATCATAGCTTGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809283.1
MSLTRHQLLWAMANTAHNNLNAKLVLLGDMGAGKSSLVIRFVKGQFLEFQESTIGAAFFSQTVSVNNATVKFEIWDTAGQERYHSLAPMYYRGAAAAIIVYDITSSDSFARAKKWVQELQKQGNPNMVMALAGNKCDLEDKRNVTAEEARAYADENGLFFLETSAKTAVNVNDIFYEIAKKLPRAQPTQNPAGMLLVDRPADGLVLHHAVVKNCLENNCTFPWMLPHLRLVMLCFSFEAVNILVFLWYSSTP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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