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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002946`

染色体: Chr04 坐标: 45793024-45794817 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002946`
名称	SmilChr04G002946
描述	uncharacterized SmilChr04G002946
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	45793024 - 45794817 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023753`
GeneID	`131023753`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023753`
原始查询	`LOC131023753`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Copia-like polyprotein/retrotransposon [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838724]; symbol=AT1G21280; hit=AT1G21280; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Copia-like polyprotein/retrotransposon [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838724]; symbol=AT1G21280; hit=AT1G21280; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G21280` (AT1G21280) Copia-like polyprotein/retrotransposon [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838724] identity=34.1; qcov=0.573; evalue=6.09e-41; confidence=low
Rice	`Os01g0909600` - identity=27.4; qcov=0.323; evalue=1.35e-07; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14244 (Retrotran_gag_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023753

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057809308.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057809308.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809308.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809308.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809308.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809308.1

384 aa

192

384

Retrotran_gag_3

PF14244 Retrotran_gag_3 23-68 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809308.1`	Pfam	`PF14244`	Retrotran_gag_3	Domain	23	68	1.7e-17	63.7	Gag-polypeptide of LTR copia-type

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953325.1
TTTACCTTTATGCTTCATCATCTTCTTCAACATGGTATCTAGAGCTAAATAGTCTTCCGCTGATCTTACTTCTTCTTCAATGGCGCCTGGTACGCCTGCCAAAAATCCTCCTTATGACGATCCGTCCAATCCTTATTTTCTTCCGAACAGCGATAGCCCCGGAGTCCAACTGGTTACTCAGCAGCTGAACGGAGCAAATTATACAAGCTGGAATCGTTCAATGATCACGGCACTTATTGCCAAAAATAAGCTCGCCTTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023753
ATGGCGCCTGGTACGCCTGCCAAAAATCCTCCTTATGACGATCCGTCCAATCCTTATTTTCTTCCGAACAGCGATAGCCCCGGAGTCCAACTGGTTACTCAGCAGCTGAACGGAGCAAATTATACAAGCTGGAATCGTTCAATGATCACGGCACTTATTGCCAAAAATAAGCTCGCCTTCGTCGATGGCTCGCTTCCTCGCCCACACCACTCAGATCTGCTTTTCACTCAATGGATGCGGTGTAACAGCATGGTGGTTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809308.1
MAPGTPAKNPPYDDPSNPYFLPNSDSPGVQLVTQQLNGANYTSWNRSMITALIAKNKLAFVDGSLPRPHHSDLLFTQWMRCNSMVVSWLRNSVNPEISSSIIYIDDAAHIWNDLKDRFSQGNLARICQLKQQLFTLKQGSDDVGAYFTKLRVLWDEYRDYQPVRWCICDNCRCNSSRKWNEFQMQECSMQFLIGLNASYSQIRSQIISTTPFPSLSKIFALVLQEERQRSIDFTPTPLTSGNGDISGSLINAAGYARGKP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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