当前解析结果
SmilChr04G002956| 统一新 Gene ID | SmilChr04G002956 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G002956 |
| 描述 | N-acylphosphatidylethanolamine synthase |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 45904265 - 45908564 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131023763 |
|---|---|
| GeneID | 131023763 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023763 |
| 原始查询 | LOC131023763 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | N-acylphosphatidylethanolamine synthase |
| 产物 | N-acylphosphatidylethanolamine synthase |
| Arabidopsis | AT1G78690 (At1g78690p)Phospholipid/glycerol acyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844205] identity=64.1; qcov=0.995; evalue=7.08e-94; confidence=high |
| Rice | Os04g0667000- identity=69; qcov=0.338; evalue=2.26e-33; confidence=low |
| GO | GO:0006644 (phospholipid metabolic process); GO:0008374 (GO:0008374) |
| KEGG | smil00564 (Glycerophospholipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | PF01553 (Acyltransferase) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023763 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057809324.1 |
| 2 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 1.00000 | XP_057809325.1 |
| 3 | Mitochondrion outer membrane | 线粒体外膜 | 0.80000 | XP_057809325.1 |
| 4 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057809324.1 |
| 5 | Peroxisome | 过氧化物酶体 | 0.20000 | XP_057809326.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:45906032 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B13,B26,B3,B67 |
Chr4:45907072 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr4:45908326 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,B59 |
Chr4:45908355 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B81,C6 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057809324.1PF01553
Acyltransferase 53-180 aa
XP_057809325.1PF01553
Acyltransferase 53-180 aa
XP_057809326.1PF01553
Acyltransferase 21-112 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057809324.1 |
Pfam | PF01553 |
Acyltransferase | Family | 53 | 180 | 1.5e-16 | 61.1 | Acyltransferase |
XP_057809325.1 |
Pfam | PF01553 |
Acyltransferase | Family | 53 | 180 | 1.4e-16 | 61.2 | Acyltransferase |
XP_057809326.1 |
Pfam | PF01553 |
Acyltransferase | Family | 21 | 112 | 1.2e-10 | 42.0 | Acyltransferase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA3 records
下载 CDS FASTA3 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。