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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002961`

染色体: Chr04 坐标: 45964960-45968586 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002961`
名称	SmilChr04G002961
描述	probable L-type lectin-domain containing receptor kinase S.5
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	45964960 - 45968586 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023766`
GeneID	`131023766`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023766`
原始查询	`LOC131023766`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable L-type lectin-domain containing receptor kinase S.5
产物	probable L-type lectin-domain containing receptor kinase S.5
Arabidopsis	`AT5G06740` (AT5G06740) Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830563] identity=40.2; qcov=0.962; evalue=6e-147; confidence=medium
Rice	`Os06g0328400` - identity=47.4; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0030246 (carbohydrate binding)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00139 (Lectin_legB); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023766

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057809331.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809331.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809331.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809331.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809331.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:45965319`	`TAC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	14	A19,A7,B109,B112,B119,B131,B140,B54,C15,C34,C43,C56,C79,D10
`Chr4:45965325`	`C`	`CGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	14	A19,A7,B109,B112,B119,B131,B140,B54,C15,C34,C43,C56,C79,D10
`Chr4:45965336`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B103,B117,C41,D10
`Chr4:45965399`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:45965413`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr4:45965435`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr4:45965536`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B48,B60,C83
`Chr4:45965539`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,B41
`Chr4:45965651`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr4:45965666`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr4:45965683`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr4:45965840`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809331.1

680 aa

340

680

Lectin_legB

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00139 Lectin_legB 28-279 aa PF00069 Pkinase 348-551 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 350-555 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809331.1`	Pfam	`PF00139`	Lectin_legB	Domain	28	279	1.1e-58	199.4	Legume lectin domain
`XP_057809331.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	348	551	3.1e-44	152.1	Protein kinase domain
`XP_057809331.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	350	555	4.9e-47	161.1	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953348.1
GAGTATTTATATTTGGGCGTCAAACGTTCCAGCATCAAAGAATTTCCTTGTGTTGCGAGTATATAGGAAAGTCAGCTTTACAAATTACAAAACCACGCCAGATTATTACTACTAATCAAAATAAACTGCAAAATAGCAAGTTCCCAGCAAATGCAGGCTAGAGTGAGACGACCAATGACTGCATTATTGTTTATTTAAACGTGAAAGTTCTGCCTTTGCCCCCATTCAACATTATTTTTATTGGATACTCGAAATATAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023766
ATGTCCGCCGCCCTCCTCCTCCTCCTCTGCTTGGCCGTGGCCGTTGCAGAAGCCACCAAGATGAAAACCTTCAACGAAAGATACCAGGGTTTCGAATTCGGAAAATACAAGGACATCATTCTGGTAGGCAACGCAACCATCAACAACGGGGCTCTGCAAGTAACCAATGATAGTGCTAATCCTGCTGCCATCTCCCATGTTTCTGGTCGCATCCTCCTCAACAAGCGCTTTCGCCTCTGGGAAGGCGACCCCGACTCCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809331.1
MSAALLLLLCLAVAVAEATKMKTFNERYQGFEFGKYKDIILVGNATINNGALQVTNDSANPAAISHVSGRILLNKRFRLWEGDPDSTTAPPRQPSFNTSFLVNMFPVPNVTAGEGLAFVIVPTRFALPFNSSGQFLGLTNASTDGATGNEVIAVELDTFKQEFDPDDNHIGLDLHSVRSVVVQPLAPYNIVLASNPARFYNVWVDYDGTNRRIQVYIAEQAGKDVATPLKPREPILSYGLNLTDHVNRDSYFGFAASTGS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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