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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002967`

染色体: Chr04 坐标: 46026363-46027266 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002967`
名称	SmilChr04G002967
描述	uncharacterized SmilChr04G002967
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	46026363 - 46027266 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023770`
GeneID	`131023770`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023770`
原始查询	`LOC131023770`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsISC42; symbol=OsISC42; hit=Os08g0323400; species=rice; confidence=medium
产物	OsISC42; symbol=OsISC42; hit=Os08g0323400; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G54500` (AT1G54500) Rubredoxin-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841892] identity=65.6; qcov=0.782; evalue=4.19e-58; confidence=high
Rice	`Os08g0323400` (OsISC42) - identity=82.7; qcov=0.57; evalue=4.89e-66; confidence=medium
GO	GO:0005506 (iron ion binding); GO:0009055 (electron transfer activity); GO:0009507 (chloroplast); GO:0043448 (alkane catabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00301 (Rubredoxin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023770

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057809335.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057809335.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057809335.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809335.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809335.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:46026646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr4:46026714`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B54,C58,D11
`Chr4:46026777`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B105
`Chr4:46026777`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B105
`Chr4:46027081`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B29,C75
`Chr4:46027081`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B29,C75
`Chr4:46027090`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B29,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809335.1

193 aa

193

Rubredoxin

PF00301 Rubredoxin 98-143 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809335.1`	Pfam	`PF00301`	Rubredoxin	Domain	98	143	7.1e-18	65.1	Rubredoxin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953352.1
CTGCATATGTTGCCTTATCCACTTCCCATTTAACAACGTAGGTATATACTCCACTTTATACTCTTTAGAAAATTCATCTTCAATTTCCTGGCAAATTTGGAGCCACAAAAGGAATTATTTTCTTATTTATTTTTCCTCAACAAAATTGCAACGACAGCCAAAAAGAAAACAAAAATAAAAAAAGAGGCACCAAAAATAACAGAAAAAAATAATGATAATGTGTTCCTCTACCACCAGACCTTCCTTCACACTCTTCACCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023770
ATGATAATGTGTTCCTCTACCACCAGACCTTCCTTCACACTCTTCACCATCTCCGCCCCTTGTCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCTGCTGCTCTTCAAACCCCCCACCGCATTCCCCACGCTCCTCCACCGCGCCAAAACCCTCACCTCCATAAAATCCATCGACGTCTCCAAAGAAGATAAGCAAGACCAAGACCAAGACCTGCCGGCTCCGCCGGAGGATGAGGAGCCGGAGACGAATCTCGGCGCGCGGCGATTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809335.1
MIMCSSTTRPSFTLFTISAPCPPPPPPPLLLFKPPTAFPTLLHRAKTLTSIKSIDVSKEDKQDQDQDLPAPPEDEEPETNLGARRLEEKFAVVNTGIYECRSCGYKYNEAAGDPSYPVPPGLPFDKLPDDWRCPTCGASQSFFESKRMEIAGFEQNQQFGLGGNALTSGQKLLLIYGGLLLGFALFLSGYFLQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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