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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002971`

染色体: Chr04 坐标: 46076291-46079631 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002971`
名称	SmilChr04G002971
描述	thioredoxin reductase NTRB-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	46076291 - 46079631 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023774`
GeneID	`131023774`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023774`
原始查询	`LOC131023774`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	thioredoxin reductase NTRB-like
产物	thioredoxin reductase NTRB-like
Arabidopsis	`AT2G17420` (NTRA) NADPH-dependent thioredoxin reductase A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816248] identity=83.1; qcov=0.895; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0713400` (OsNTRB) - identity=77.3; qcov=0.895; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004791 (thioredoxin-disulfide reductase (NADPH) activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0019430 (removal of superoxide radicals)
KEGG	smil00450 (Selenocompound metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00070 (Pyr_redox); PF07992 (Pyr_redox_2); PF13738 (Pyr_redox_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023774

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057809340.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057809340.1`
3	Mitochondrion intermembrane space	Mitochondrion intermembrane space	0.20000	`XP_057809340.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809340.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809340.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:46076580`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B90,B92,C87
`Chr4:46076663`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B90,B92,C87
`Chr4:46077117`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B135
`Chr4:46077489`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B12
`Chr4:46077489`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B12
`Chr4:46077513`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr4:46077574`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B125
`Chr4:46077580`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,D9
`Chr4:46079416`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B15,B90,C13,C25,D3,D6
`Chr4:46079457`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B81,C58,C6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809340.1

370 aa

185

370

Pyr_redox_2

Pyr_redox_3

Pyr_redox

PF07992 Pyr_redox_2 54-348 aa PF13738 Pyr_redox_3 133-331 aa PF00070 Pyr_redox 202-264 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809340.1`	Pfam	`PF07992`	Pyr_redox_2	Domain	54	348	2.8e-48	165.5	Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
`XP_057809340.1`	Pfam	`PF13738`	Pyr_redox_3	Family	133	331	3.4e-18	66.7	Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
`XP_057809340.1`	Pfam	`PF00070`	Pyr_redox	Domain	202	264	5.4e-17	62.8	Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953357.1
TATATGTTTTTTGTTTTTTCAAAAAGAAAAATATCAGTCCATCGTTAAACCATCTCTCATCTTTCAAAACCAAACGTTGAAGACTTGTGATAGAACAGACTTGACACTTACCCTAAAAATCATAAAAGAATAATTTAAATATGAACACAATACAAAAGCAAAACCCTAGTTCAAAACCTTGACCCGCTCAATTTCAATTGAAATCCCAATTCTCAAAATCACCATTTAAGTATATTTTACACCCACAAATGACCCATAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023774
ATGACCCATAACTGTTTCTCCAAATTCCTCCACACTCTCAAGAAAGCCCGCAACCTTATTGGCGTCGCCGCCCTATCCACCACCACCACCGCCGCCGCCACAGCTGCAGCTTCCCCCAAGTTCTCAGCCATGGAAGGCGACCTTCAGACCCTCAAAACCCGCGTTTGCATCGTCGGCAGCGGCCCCGCCGCCCACACCGCCGCGATCTACGCCGCCCGCGCCGAGCTCAAGCCCATTCTCTTCGAGGGCTGGATGGCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809340.1
MTHNCFSKFLHTLKKARNLIGVAALSTTTTAAATAAASPKFSAMEGDLQTLKTRVCIVGSGPAAHTAAIYAARAELKPILFEGWMANDIAPGGQLTTTSEVENFPGFPEGIGGIDLMEKCRAQSVKFGTQIFTETVSKVDFSGFPFKIFSDSRTVLADSVILATGAVAKRLNFPGSDTFWNRGISACAVCDGAAPIFRNKPLAVIGGGDSAMEEANFLTKYGSKVYIIHRRNEFRASKIMQNRAQTNPKIEVLWNSVVTE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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