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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002989`

染色体: Chr04 坐标: 46305962-46309106 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002989`
名称	SmilChr04G002989
描述	uncharacterized SmilChr04G002989
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	46305962 - 46309106 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023791`
GeneID	`131023791`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023791`
原始查询	`LOC131023791`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2746218]; symbol=AT5G66005; hit=AT5G66005; species=arabidopsis; confidence=high
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2746218]; symbol=AT5G66005; hit=AT5G66005; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G66005` (AT5G66005) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2746218] identity=70.3; qcov=0.963; evalue=1.58e-76; confidence=high
Rice	`Os03g0130750` - identity=76.1; qcov=0.547; evalue=2.05e-44; confidence=medium
GO	GO:0016887 (ATP hydrolysis activity)
KEGG	smil00230 (Purine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00730 (Thiamine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01232 (Nucleotide metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03266 (NTPase_1); PF13245 (AAA_19)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023791

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057809367.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057809368.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057809367.1`
4	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057809367.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809368.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:46306376`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr4:46307385`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809367.1

192 aa

192

AAA_19

NTPase_1

PF13245 AAA_19 2-121 aa PF03266 NTPase_1 8-181 aa

XP_057809368.1

161 aa

161

AAA_19

NTPase_1

PF13245 AAA_19 2-121 aa PF03266 NTPase_1 8-147 aa

XP_057809369.1

161 aa

161

AAA_19

NTPase_1

PF13245 AAA_19 2-121 aa PF03266 NTPase_1 8-147 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809367.1`	Pfam	`PF13245`	AAA_19	Domain	2	121	4.8e-06	27.5	AAA domain
`XP_057809367.1`	Pfam	`PF03266`	NTPase_1	Domain	8	181	3.6e-46	157.8	NTPase
`XP_057809368.1`	Pfam	`PF13245`	AAA_19	Domain	2	121	3.2e-06	28.1	AAA domain
`XP_057809368.1`	Pfam	`PF03266`	NTPase_1	Domain	8	147	7.4e-40	137.3	NTPase
`XP_057809369.1`	Pfam	`PF13245`	AAA_19	Domain	2	121	3.2e-06	28.1	AAA domain
`XP_057809369.1`	Pfam	`PF03266`	NTPase_1	Domain	8	147	7.4e-40	137.3	NTPase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953384.1
ACACTATTGGTGTTGATGTTGGGAAGCACAGAAACGATAAAGGGTGGGGACCAAAAAACGAATTTTACTCTTTTCGAGAGTCCAGTCTAGACGCTGTCGTCGCAATTTGGCTGCGCTTCTGCAATGGCGGCCACCGGAAAATGCATTCTCGTCACCGGTTCTCCCGGAGTGGGGAAAACTACTCTGATAACCCGAGTTCTGGATGCCCTTAAACTATTGAATCCCAGCTTAAAGATTCAGGGTTTCTATACTCGTGAGGT...

XM_057953385.1
ATTGGTGTTGATGTTGGGAAGCACAGAAACGATAAAGGGTGGGGACCAAAAAACGAATTTTACTCTTTTCGAGAGTCCAGTCTAGACGCTGTCGTCGCAATTTGGCTGCGCTTCTGCAATGGCGGCCACCGGAAAATGCATTCTCGTCACCGGTTCTCCCGGAGTGGGGAAAACTACTCTGATAACCCGAGTTCTGGATGCCCTTAAACTATTGAATCCCAGCTTAAAGATTCAGGGTTTCTATACTCGTGAGGTAAGAG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131023791
ATGGCGGCCACCGGAAAATGCATTCTCGTCACCGGTTCTCCCGGAGTGGGGAAAACTACTCTGATAACCCGAGTTCTGGATGCCCTTAAACTATTGAATCCCAGCTTAAAGATTCAGGGTTTCTATACTCGTGAGGTAAGAGAAGGGTTTGACAGGGTAGGATTTGAAGTGGTTACTGTTGATGGCCGTAGAGGTCCTCTGGCATCCTCCAATAACACTAGCCGGGAATCTCACAAATGGCCTAATGTGGGGAGGTACAA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057809367.1
MAATGKCILVTGSPGVGKTTLITRVLDALKLLNPSLKIQGFYTREVREGFDRVGFEVVTVDGRRGPLASSNNTSRESHKWPNVGRYKVDVSSFESSALPELEVKEDTDLFIIDEVGKMELFSSSFFPAVLRVLESNIPLLATVPVPKSGRDIPGVSRLKNHPGATIYTLNTSNRDAMKEQIYSNLVDLLQNH

XP_057809368.1
MAATGKCILVTGSPGVGKTTLITRVLDALKLLNPSLKIQGFYTREVREGFDRVGFEVVTVDGRRGPLASSNNTSRESHKWPNVGRYKVDVSSFESSALPELEVKEDTDLFIIDEVGKMELFSSSFFPAVLRVLESNIPLLATVPVPKSGRDIPGVHVNKGA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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