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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002990`

染色体: Chr04 坐标: 46312248-46314025 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002990`
名称	SmilChr04G002990
描述	HMG1/2-like protein
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	46312248 - 46314025 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023792`
GeneID	`131023792`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023792`
原始查询	`LOC131023792`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	HMG1/2-like protein
产物	HMG1/2-like protein
Arabidopsis	`AT1G20693` (HMGB2) high mobility group B2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838658] identity=67.3; qcov=0.974; evalue=8.66e-58; confidence=high
Rice	`Os09g0551600` - identity=56; qcov=0.934; evalue=4.3e-46; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00505 (HMG_box); PF09011 (HMG_box_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023792

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809370.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057809371.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057809370.1`
4	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057809371.1`
5	Nucleolus	核仁	0.40000	`XP_057809371.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:46312834`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C56
`Chr4:46312843`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:46313113`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr4:46313119`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B31
`Chr4:46313279`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809370.1

154 aa

154

HMG_box_2

HMG_box

PF09011 HMG_box_2 39-110 aa PF00505 HMG_box 42-111 aa

XP_057809371.1

151 aa

151

HMG_box_2

HMG_box

PF09011 HMG_box_2 39-110 aa PF00505 HMG_box 42-111 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809370.1`	Pfam	`PF09011`	HMG_box_2	Domain	39	110	3.8e-14	53.8	HMG-box domain
`XP_057809370.1`	Pfam	`PF00505`	HMG_box	Domain	42	111	9.8e-22	77.9	HMG (high mobility group) box
`XP_057809371.1`	Pfam	`PF09011`	HMG_box_2	Domain	39	110	3.6e-14	53.9	HMG-box domain
`XP_057809371.1`	Pfam	`PF00505`	HMG_box	Domain	42	111	9.2e-22	78.0	HMG (high mobility group) box

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953388.1
TATTTGTTTAATAAAGGGCCACAACGACCCCTGCCATGCCCTAAACCGTCATATTACAAAGGTTAGTTCGGTCATTACACCACAAAGGCACTTAACCCCCCGAGCCGCTGCGATCGCGCCACGTGCCCCTACTGTACCGCCAGCACCACATCCAACGGCTTCCACCCCCTCCGCAACAAACACAGAGAAAACACAGAGCCAAGAGAAGGTGCTGCGCACAACCAATCTAACCAATCAGAACGCTTGGATCGGCTTCACTT...

XM_057953387.1
AGAACGCTTGGATCGGCTTCACTTGGATCAATGATGTGGCGGGGGGAAATTGAAATCCCGCCCAAACCCGGACTTCAATTTGGTTTGTGAGTGAATTTTGGAAGAATTTTTGAGGCTCTTTCCTTTCAGACCCCTTATCCCTCCCTTTCACATATACCACTCTCTCGCTAACGCATACAACACCAACGCAAAGCATATCTCTTCGTTTCTCTCTCTCTACCACACTCTCTCTCTAGATTCTCATTATTAGGTTCGACATG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131023792
ATGAAAGGAGGAAGATCCAAGACCGAGTCGAAGAAAGCTGATGCGAAGCTTTCGGTGAAGAAAGGAGCCGCAGCCGGGAAAAAGCCGGTGAAGAAGGGGAAGCCGGCTAAGGATCCGAACAAGCCTAAGAGGCCTGCCAGTGCCTTCTTCGTCTTCATGGAGGACTTCAGGAAGACTTACAAGGAGAAGCACCCTAACAACAAATCAGTCTCCGCTGTTGGAAAAGCTGGTGGGGAGAAATGGAAATCCATGTCTGAGGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057809370.1
MKGGRSKTESKKADAKLSVKKGAAAGKKPVKKGKPAKDPNKPKRPASAFFVFMEDFRKTYKEKHPNNKSVSAVGKAGGEKWKSMSEAEKAPFVAKAEKRKVDYEKTLQAYNKKLSDGPGADDESDKSKSEVNDDEDDDEDGSADVIICVIFHPN

XP_057809371.1
MKGGRSKTESKKADAKLSVKKGAAAGKKPVKKGKPAKDPNKPKRPASAFFVFMEDFRKTYKEKHPNNKSVSAVGKAGGEKWKSMSEAEKAPFVAKAEKRKVDYEKTLQAYNKKLSDGPGADDESDKSKSEVNDDEDDDEDGSADDDEDDDE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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