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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002992`

染色体: Chr04 坐标: 46343117-46345491 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002992`
名称	SmilChr04G002992
描述	uncharacterized SmilChr04G002992
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	46343117 - 46345491 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023794`
GeneID	`131023794`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023794`
原始查询	`LOC131023794`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0133600; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os11g0133600; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G66010` (AT5G66010) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836731] identity=62.8; qcov=1.01; evalue=1.12e-100; confidence=high
Rice	`Os11g0133600` - identity=61; qcov=1.05; evalue=4.81e-101; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:1990904 (ribonucleoprotein complex)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1); PF28441 (RRM_11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023794

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809373.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057809374.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057809374.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057809374.1`
5	Nuclear speckle	核斑点	0.20000	`XP_057809373.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:46345013`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr4:46345043`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B34,C2,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809373.1

263 aa

132

263

RRM_11

RRM_1

RRM_11

RRM_1

PF28441 RRM_11 60-137 aa PF00076 RRM_1 61-123 aa PF28441 RRM_11 177-257 aa PF00076 RRM_1 178-243 aa

XP_057809374.1

236 aa

118

236

RRM_11

RRM_1

RRM_11

RRM_1

PF28441 RRM_11 33-110 aa PF00076 RRM_1 34-96 aa PF28441 RRM_11 150-230 aa PF00076 RRM_1 151-216 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809373.1`	Pfam	`PF28441`	RRM_11	Domain	60	137	3.2e-40	137.1	RRM domain
`XP_057809373.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	61	123	6.1e-19	68.4	RNA recognition motif
`XP_057809373.1`	Pfam	`PF28441`	RRM_11	Domain	177	257	3.2e-40	137.1	RRM domain
`XP_057809373.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	178	243	6.1e-19	68.4	RNA recognition motif
`XP_057809374.1`	Pfam	`PF28441`	RRM_11	Domain	33	110	2.1e-40	137.7	RRM domain
`XP_057809374.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	34	96	4.3e-19	68.9	RNA recognition motif
`XP_057809374.1`	Pfam	`PF28441`	RRM_11	Domain	150	230	2.1e-40	137.7	RRM domain
`XP_057809374.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	151	216	4.3e-19	68.9	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953390.1
GGGTTTGCTCCGCAAACGAAACGTCGTTAGTTTAGGTCGAATGACTTTAAGCCGATGCATTAATTTACTACTATGGTAGCTGAATCTCTAATTGGGACCTAGGGTTCGAATTTGCGTGATTATCCACCTCTGCGAAAACGCCCTTCCACTGCTGCTGGTTTTAGTTTCGATCTGCGCCGTTGTGTTCGAGATCTAGCGGAAGCCATGTACGGTCATAGAAGGTCATTGTTTGGGAGCGGGGGGGTTTCAGACGGGTACGA...

XM_057953391.1
TAAGCCGATGCATTAATTTACTACTATGGTAGCTGAATCTCTAATTGGGACCTAGGGTTCGAATTTGCGTGATTATCCACCTCTGCGAAAACGCCCTTCCACTGCTGCTGGTTTTAGTTTCGATCTGCGCCGTTGTGTTCGAGATCTAGCGGAAGCCATGTACGGTCATAGAAGTGGGGGATTCTTCCTTCCCTGGGTGTGAATAATTGAAGGTCATTGTTTGGGAGCGGGGGGGTTTCAGACGGGTACGAGATCGGCTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131023794
ATGTACGGTCATAGAAGGTCATTGTTTGGGAGCGGGGGGGTTTCAGACGGGTACGAGATCGGCTCAAAGAGACCAAGATTGATGGAACCAAATCCCTACTTCGCAGTGAGCAGCAGTTCGAGTGGCTATCAACAGTACGGCTATGGCAGGAGATATCAGCCATCTACCTTTCCCGTGGTTCGTCTAAGGGGTCTCCCCTTCAACTGCACGGACATAGACATTTTCAAATTTTTTGCTGGACTGGACATTGTGGACGTCTT...

LOC131023794
ATGGAACCAAATCCCTACTTCGCAGTGAGCAGCAGTTCGAGTGGCTATCAACAGTACGGCTATGGCAGGAGATATCAGCCATCTACCTTTCCCGTGGTTCGTCTAAGGGGTCTCCCCTTCAACTGCACGGACATAGACATTTTCAAATTTTTTGCTGGACTGGACATTGTGGACGTCTTCTTGGTGAACAAGGATGGGAGGTTCTCTGGAGAAGCATTTATAGTCTTTGCCGGTCATATGCAGGCTGAACTTGCTCTGCA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057809373.1
MYGHRRSLFGSGGVSDGYEIGSKRPRLMEPNPYFAVSSSSSGYQQYGYGRRYQPSTFPVVRLRGLPFNCTDIDIFKFFAGLDIVDVFLVNKDGRFSGEAFIVFAGHMQAELALQRDRQTMGRRYVEVFRCKKQEYYNAIAAEVSEGGVDNNHRGSSPVARRKRSPDKDKLEYTEILKLRGLPYSVKKSDILKFFGDFEVVEDKIQIACKPDGKVTGEAFVEFVSVEEARKAMCKDKMLIGSRYVELFPSARDEARQAASR...

XP_057809374.1
MEPNPYFAVSSSSSGYQQYGYGRRYQPSTFPVVRLRGLPFNCTDIDIFKFFAGLDIVDVFLVNKDGRFSGEAFIVFAGHMQAELALQRDRQTMGRRYVEVFRCKKQEYYNAIAAEVSEGGVDNNHRGSSPVARRKRSPDKDKLEYTEILKLRGLPYSVKKSDILKFFGDFEVVEDKIQIACKPDGKVTGEAFVEFVSVEEARKAMCKDKMLIGSRYVELFPSARDEARQAASRSRQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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