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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002996`

染色体: Chr04 坐标: 46369854-46371935 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002996`
名称	SmilChr04G002996
描述	dehydrodolichyl diphosphate synthase 6-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	46369854 - 46371935 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023798`
GeneID	`131023798`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023798`
原始查询	`LOC131023798`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dehydrodolichyl diphosphate synthase 6-like
产物	dehydrodolichyl diphosphate synthase 6-like
Arabidopsis	`AT2G17570` (cPT1) Undecaprenyl pyrophosphate synthetase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816264] identity=58; qcov=1.01; evalue=4.49e-122; confidence=high
Rice	`Os06g0167400` - identity=45.5; qcov=0.989; evalue=2.89e-91; confidence=high
GO	GO:0002094 (GO:0002094); GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0016094 (polyprenol biosynthetic process)
KEGG	smil00900 (Terpenoid backbone biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01255 (Prenyltransf)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023798

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057809378.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057809378.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057809378.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809378.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809378.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:46371115`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B69
`Chr4:46371663`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,C58,C72,C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809378.1

282 aa

141

282

Prenyltransf

PF01255 Prenyltransf 41-270 aa

XP_057809379.1

282 aa

141

282

Prenyltransf

PF01255 Prenyltransf 41-270 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809378.1`	Pfam	`PF01255`	Prenyltransf	Family	41	270	2.2e-64	217.7	Putative undecaprenyl diphosphate synthase
`XP_057809379.1`	Pfam	`PF01255`	Prenyltransf	Family	41	270	2.2e-64	217.7	Putative undecaprenyl diphosphate synthase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953395.1
TTCTCACCTGTTTTCCCCTATAAAGATGAGCCTAATTTCTCACCGAGAATCAGCAATCGGTCTTCCTAAATTCTTTTCCTCTTTTTAAACAACCATTGTTGAGCAGTGTTGCAAAATTCTTGAACAAGGTTGTGCTTCCTTTCACTTCAAAAGAAGCAGAAATAGAAATGGAGAGCAGCAGGAGCAACAACATTGTTGTGAAGGTGTTTGGGAGTTCAGTGAGCTACATGAGGAGATGGCTGTTCCGGGCGCTGTCAGTG...

XM_057953396.1
AATCGGTCTTCCTAAATTCTTTTCCTCTTTTTAAACAACCATTGTTGAGCAGTGTTGCAAAATTCTTGAACAAGGTTGTGCTTCCTTTCACTTCAAAAGAAATGGAGAGCAGCAGGAGCAACAACATTGTTGTGAAGGTGTTTGGGAGTTCAGTGAGCTACATGAGGAGATGGCTGTTCCGGGCGCTGTCAGTGGGGGCGATCCCAAGGCACGTGGCGTTCATCCTGGACGGGAACAGGAGGTACGCCAGGAAATGGAAC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131023798
ATGGAGAGCAGCAGGAGCAACAACATTGTTGTGAAGGTGTTTGGGAGTTCAGTGAGCTACATGAGGAGATGGCTGTTCCGGGCGCTGTCAGTGGGGGCGATCCCAAGGCACGTGGCGTTCATCCTGGACGGGAACAGGAGGTACGCCAGGAAATGGAACTTGGGGGAGGGGATGGGCCACAGGGCCGGCTTCCTCTCCCTCATGACCCTCATGAAGTACTGCTACGAGCTGGGAGTCAAGTATGTCACCATCTACGCCTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057809378.1
MESSRSNNIVVKVFGSSVSYMRRWLFRALSVGAIPRHVAFILDGNRRYARKWNLGEGMGHRAGFLSLMTLMKYCYELGVKYVTIYAFSIDNFKRKPEEVQYVMDLMLEKIEGLLKEESIVNQYGVRVEFVGNLKLLSDPVRLAAERAMELTAKNSRAILLIAVAYTSTDEIAHAAQQSCLDKIQTRSGFCFGFAKADDDAITIRLGDVESHMYMGVAPDPDILVRTSGETRLSNFLLWQTSNSLLYSPRALWPEMGLRHL...

XP_057809379.1
MESSRSNNIVVKVFGSSVSYMRRWLFRALSVGAIPRHVAFILDGNRRYARKWNLGEGMGHRAGFLSLMTLMKYCYELGVKYVTIYAFSIDNFKRKPEEVQYVMDLMLEKIEGLLKEESIVNQYGVRVEFVGNLKLLSDPVRLAAERAMELTAKNSRAILLIAVAYTSTDEIAHAAQQSCLDKIQTRSGFCFGFAKADDDAITIRLGDVESHMYMGVAPDPDILVRTSGETRLSNFLLWQTSNSLLYSPRALWPEMGLRHL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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