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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002997`

染色体: Chr04 坐标: 46372283-46373410 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002997`
名称	SmilChr04G002997
描述	dehydrodolichyl diphosphate synthase 6-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	46372283 - 46373410 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023800`
GeneID	`131023800`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023800`
原始查询	`LOC131023800`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dehydrodolichyl diphosphate synthase 6-like
产物	dehydrodolichyl diphosphate synthase 6-like
Arabidopsis	`AT2G17570` (cPT1) Undecaprenyl pyrophosphate synthetase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816264] identity=53.8; qcov=1.03; evalue=1.1e-110; confidence=high
Rice	`Os06g0167400` - identity=45.9; qcov=1.02; evalue=7.68e-89; confidence=high
GO	GO:0002094 (GO:0002094); GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0016094 (polyprenol biosynthetic process)
KEGG	smil00900 (Terpenoid backbone biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01255 (Prenyltransf)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023800

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057809381.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057809381.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809381.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809381.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809381.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:46372632`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr4:46372649`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr4:46372709`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr4:46373127`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,A6,B113,C26,C73
`Chr4:46373170`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B60
`Chr4:46373170`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B60
`Chr4:46373241`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C39
`Chr4:46373241`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C39
`Chr4:46373244`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809381.1

293 aa

146

293

Prenyltransf

PF01255 Prenyltransf 62-277 aa

XP_057809383.1

272 aa

136

272

Prenyltransf

PF01255 Prenyltransf 41-256 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809381.1`	Pfam	`PF01255`	Prenyltransf	Family	62	277	2.3e-66	224.2	Putative undecaprenyl diphosphate synthase
`XP_057809383.1`	Pfam	`PF01255`	Prenyltransf	Family	41	256	1.8e-66	224.5	Putative undecaprenyl diphosphate synthase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953398.1
CAGCCCACATTTGGCCGTAATAATCGCCCTCACCAAGACTGTGGTATCATGCTATGCAACTACTACAACTTGCTATAAAATATTTATGTGTTGCAGTTTCGATATTCAAAAGGGTTTTTCTCCAATGTTAATGATTAAGTTGCTGCAGATGATGGAGCGACAGAGCAGCAGCCTAGTGGTGCGGTTGCTGGGGAGTTCGGCGAGCTACATGAGGAGGTTCCTGTTCCGCGTGCTGTCGGTGGGACCGGTGCCACACCACG...

XM_057953400.1
TCACCAAGACTGTGGTATCATGCTATGCAACTACTACAACTTGCTATAAAATATTTATGTGTTGCAGTTTCGATATTCAAAAGGGTTTTTCTCCAATGTTAATGATTAAGTTGCTGCAGGTAGATGATGGAGCGACAGAGCAGCAGCCTAGTGGTGCGGTTGCTGGGGAGTTCGGCGAGCTACATGAGGAGGTTCCTGTTCCGCGTGCTGTCGGTGGGACCGGTGCCACACCACGTGGCGTTCATCCTAGACGGGAACCG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131023800
ATGTGTTGCAGTTTCGATATTCAAAAGGGTTTTTCTCCAATGTTAATGATTAAGTTGCTGCAGATGATGGAGCGACAGAGCAGCAGCCTAGTGGTGCGGTTGCTGGGGAGTTCGGCGAGCTACATGAGGAGGTTCCTGTTCCGCGTGCTGTCGGTGGGACCGGTGCCACACCACGTGGCGTTCATCCTAGACGGGAACCGGAGGTTTGCCCGGAAGTGGAAGATGGAAGACGTAATGGGGTACAGGGCGGGGTTCCTGTC...

LOC131023800
ATGATGGAGCGACAGAGCAGCAGCCTAGTGGTGCGGTTGCTGGGGAGTTCGGCGAGCTACATGAGGAGGTTCCTGTTCCGCGTGCTGTCGGTGGGACCGGTGCCACACCACGTGGCGTTCATCCTAGACGGGAACCGGAGGTTTGCCCGGAAGTGGAAGATGGAAGACGTAATGGGGTACAGGGCGGGGTTCCTGTCCCTGATGACGCTGATCAAGTGCTGCTATGAGCTCGGGGTGAAGTACATCACCATCTACGTGTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057809381.1
MCCSFDIQKGFSPMLMIKLLQMMERQSSSLVVRLLGSSASYMRRFLFRVLSVGPVPHHVAFILDGNRRFARKWKMEDVMGYRAGFLSLMTLIKCCYELGVKYITIYVFSIENFKRKPDEVRSVMDLMLEKIEGLLKEESILEQYGVRLEFVGNLKLLNESVRISAEKAMKATACNDRVILVVAVAYTSTDEMVHAAEQCCQDKSVDGKLVEVADVERHMYMAGVPDPDILVRTSGETRLSNFLLWQTSNSLLYSPKALWP...

XP_057809383.1
MMERQSSSLVVRLLGSSASYMRRFLFRVLSVGPVPHHVAFILDGNRRFARKWKMEDVMGYRAGFLSLMTLIKCCYELGVKYITIYVFSIENFKRKPDEVRSVMDLMLEKIEGLLKEESILEQYGVRLEFVGNLKLLNESVRISAEKAMKATACNDRVILVVAVAYTSTDEMVHAAEQCCQDKSVDGKLVEVADVERHMYMAGVPDPDILVRTSGETRLSNFLLWQTSNSLLYSPKALWPDVGLHHLIWAVLNFQRVQPYL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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