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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003001`

染色体: Chr04 坐标: 46408449-46422261 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003001`
名称	SmilChr04G003001
描述	protein GRIP-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	46408449 - 46422261 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023804`
GeneID	`131023804`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023804`
原始查询	`LOC131023804`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein GRIP-like
产物	protein GRIP-like
Arabidopsis	`AT5G66030` (ATGRIP) Golgi-localized GRIP domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836733] identity=62; qcov=0.836; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0472500` (P0675B10.124) - identity=55.3; qcov=0.82; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0007131 (reciprocal meiotic recombination)
KEGG	-
Pfam	PF01465 (GRIP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023804

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057809388.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.80000	`XP_057809388.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057809388.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057809388.1`
5	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057809388.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:46410020`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr4:46411447`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr4:46412073`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,C16,D3,D7
`Chr4:46416015`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr4:46418109`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,B127,B60,C31
`Chr4:46418141`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B67
`Chr4:46421982`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B5,C32,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809388.1

846 aa

423

846

GRIP

PF01465 GRIP 774-814 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809388.1`	Pfam	`PF01465`	GRIP	Family	774	814	9.8e-14	51.6	GRIP domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953405.1
GTCATTTACCAAAATGCCCTCCGATGAACAATTACAAAACTTTTTTTTTTGAAGCCTGCAATTACAAAACTTGAAAGCCGATTTATGTGATGGCGGCAGCGTGTGAAGTGAGGGGCCGAATGGAATTGTGATTTCGCCAGAACAGAGCCCCCATTTCCAGCGCTGATTCGTTGCTGTTATCGTAGATACATAATTTCGCTCTTTGCAATTCGAATCGGTTTTGGTGGATCTGCGGAAATATCATACGATCTCGAATATTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023804
ATGTCTCAAGAAGAGGGTGAGAGTGGTGGGATGCCAGAAAATCATGTGGCTGATGTTGCAGAACACGAGACTAAGCAGCTTAACCCAGATAGTTCCATCGACAGTAATCTCGTGAAGGAGAATGGGCTCCATGTTGGAAATACACATTCTAATTACTACCATGACGAACTTGTACAGATGGTTCAGAATGAATATATGAAGTCTCAGGATGAGGGGTTGAAGATCCTTCTTGAATCTGATCAGCCTGACACACCAAAAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809388.1
MSQEEGESGGMPENHVADVAEHETKQLNPDSSIDSNLVKENGLHVGNTHSNYYHDELVQMVQNEYMKSQDEGLKILLESDQPDTPKVQEHDSQAGNDDSDKPDPQKIEEVDSRSGNDDSDQPDPERGSRAGDNDSDRPDPQNVEDRHSGVGDDLRDLSGEIESLKRELLEERQTRYAAEEALKHLRAAHLEADTKAQELAAKFDEAQKKMDQEIKERDEKYSELDTKFNRLHKRAKQRIQEVQKEKDDLEVQFREVNEKA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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