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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003009`

染色体: Chr04 坐标: 46460495-46463913 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003009`
名称	SmilChr04G003009
描述	thiosulfate sulfurtransferase 16, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	46460495 - 46463913 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023813`
GeneID	`131023813`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023813`
原始查询	`LOC131023813`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	thiosulfate sulfurtransferase 16, chloroplastic-like
产物	thiosulfate sulfurtransferase 16%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G35770` (SEN1) Rhodanese/Cell cycle control phosphatase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829730] identity=63.3; qcov=0.667; evalue=2.44e-52; confidence=high
Rice	`Os06g0725000` (OsStr9) - identity=69.9; qcov=0.628; evalue=1.85e-55; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00581 (Rhodanese)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023813

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057809399.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057809399.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057809399.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809399.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809399.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:46460812`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B114
`Chr4:46460812`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B114
`Chr4:46460815`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B114
`Chr4:46460815`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B114
`Chr4:46460826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B140
`Chr4:46462509`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B95,C21,C8,C81,C85
`Chr4:46462703`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,B97
`Chr4:46463671`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,B95

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809399.1

180 aa

180

Rhodanese

PF00581 Rhodanese 78-173 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809399.1`	Pfam	`PF00581`	Rhodanese	Domain	78	173	1.7e-16	61.2	Rhodanese-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953416.1
AACTCCATATATACTTCCCATGCCACACGCCATACATAATACAATCATATGTTCATATCTCCTTTGCCTCTAAAAACCAAAACTCGCGACTGCCAAAAGAAAGAAGCAAATGAGCTCCATCTCTCTTTCATTTTCTGCTGCCTTACTTCCTCTGAATCTTCCCCAAGATGCAAATACTAGGTGTGCATCTCTAAAGGTGATCAAGAATCAGCTTGGGCCGATCGTACGACGTAGTTTTAGCACCAGCCGCCGAGTTCCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023813
ATGAGCTCCATCTCTCTTTCATTTTCTGCTGCCTTACTTCCTCTGAATCTTCCCCAAGATGCAAATACTAGGTGTGCATCTCTAAAGGTGATCAAGAATCAGCTTGGGCCGATCGTACGACGTAGTTTTAGCACCAGCCGCCGAGTTCCCGGCTTCAGTGGGATGGTAGCAGAGAGCGGGAATGTGCAATCGCCTGCTGTCCCAACATCGGTCCCTGTTCGTGTCGCAAATGAACTACTTCAAGCCGGTCATCGTTATCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809399.1
MSSISLSFSAALLPLNLPQDANTRCASLKVIKNQLGPIVRRSFSTSRRVPGFSGMVAESGNVQSPAVPTSVPVRVANELLQAGHRYLDVRTTEEFSAGHVVGAVNVPFMLRRGTGMARNPKFLEEVSTHFSKDDEIIVGCQLGKRSLMAASELVSAGFTGITDMAGGYAAWVQNGLPSTA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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