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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003028`

染色体: Chr04 坐标: 46703665-46705757 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003028`
名称	SmilChr04G003028
描述	putative glutamine amidotransferase GAT1_2.1
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	46703665 - 46705757 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023831`
GeneID	`131023831`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023831`
原始查询	`LOC131023831`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative glutamine amidotransferase GAT1_2.1
产物	putative glutamine amidotransferase GAT1_2.1
Arabidopsis	`AT5G38200` (AT5G38200) Class I glutamine amidotransferase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833802] identity=75.8; qcov=0.853; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0138800` - identity=67.8; qcov=0.881; evalue=1.72e-170; confidence=high
GO	GO:0005829 (cytosol); GO:0016811 (hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds, in linear amides)
KEGG	-
Pfam	PF00117 (GATase); PF07722 (Peptidase_C26)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023831

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057809422.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057809422.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057809422.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809422.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809422.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:46704406`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr4:46704442`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,C2
`Chr4:46704465`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr4:46704478`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr4:46704479`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr4:46705031`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809422.1

420 aa

210

420

Peptidase_C26

GATase

PF07722 Peptidase_C26 28-256 aa PF00117 GATase 113-263 aa

XP_057809423.1

402 aa

201

402

Peptidase_C26

GATase

PF07722 Peptidase_C26 28-256 aa PF00117 GATase 113-263 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809422.1`	Pfam	`PF07722`	Peptidase_C26	Domain	28	256	6.2e-43	147.8	Peptidase C26
`XP_057809422.1`	Pfam	`PF00117`	GATase	Domain	113	263	1.3e-12	48.6	Glutamine amidotransferase class-I
`XP_057809423.1`	Pfam	`PF07722`	Peptidase_C26	Domain	28	256	5.7e-43	148.0	Peptidase C26
`XP_057809423.1`	Pfam	`PF00117`	GATase	Domain	113	263	1.2e-12	48.6	Glutamine amidotransferase class-I

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953439.1
AGTGAAATTGGGTTGTTATAATGTAGATAAGGCCTCCACCAAATTAGCATTCAATCCGGATATATTTAATCCATAAAATTCATATAATCCAGGTCAGTATCGCCTCGGATTGACCCATCCTCAGTCGCAACCGAATACATCTCACCGCCATCTGCCACGTTGTTTATTTACCGTTTGAATAGCACCCTCTTTCGCCCCTCTCTATATATACCCCTACGCGGCGCCTCCACTTTGCTCAACACTATTACTTCTTACCTTCT...

XM_057953440.1
CTATATATACCCCTACGCGGCGCCTCCACTTTGCTCAACACTATTACTTCTTACCTTCTTCTCATATATATAAAACTCCTGCATTCCCTTTGTGTTCGCGGGAATTTGGGATTTTAAGAATCTTTCTTGTTTTCTTTTTCTTTCCGACCGGGAATATATTGTCCTTTTGCGCATGGCTGCAGCTGATCTCTCTGTGATCTTGCCTCGTGTTCTTATCGTCTCCAGACGCAGCGTTCGTAAAAACAAGTTCGTCGATTTTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131023831
ATGGCTGCAGCTGATCTCTCTGTGATCTTGCCTCGTGTTCTTATCGTCTCCAGACGCAGCGTTCGTAAAAACAAGTTCGTCGATTTTGTCGGAGAATATCATCTAGATCTGATAGTGAGCTATGGCGCGGTACCCGTAATCGTGCCACGAGTAACAGGGGTGCACATGCTGCTGGACAGCTTCGAGCCCATCCACGGCGTCCTTCTATGCGAAGGCGAAGACATCGATCCCTCTCACTACGAAGCCGACGCCTCCAACCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057809422.1
MAAADLSVILPRVLIVSRRSVRKNKFVDFVGEYHLDLIVSYGAVPVIVPRVTGVHMLLDSFEPIHGVLLCEGEDIDPSHYEADASNLSPEELEEIRRLHASDTAIDREKDAIELGLAKLCLERNIPYLGICRGSQILNVACGGTLYQDIGKELSKNVGQQPHERVVHMDYDNYDGHRHPVRIVDATPLHQWFNHSLDDADKEIWVNSYHHQGVKKLAQRFVPMAFAPDGLVEAFYDPDAYNPDDGKFIMGLQFHPERMRK...

XP_057809423.1
MAAADLSVILPRVLIVSRRSVRKNKFVDFVGEYHLDLIVSYGAVPVIVPRVTGVHMLLDSFEPIHGVLLCEGEDIDPSHYEADASNLSPEELEEIRRLHASDTAIDREKDAIELGLAKLCLERNIPYLGICRGSQILNVACGGTLYQDIGKELSKNVGQQPHERVVHMDYDNYDGHRHPVRIVDATPLHQWFNHSLDDADKEIWVNSYHHQGVKKLAQRFVPMAFAPDGLVEAFYDPDAYNPDDGKFIMGLQFHPERMRK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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