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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003044`

染色体: Chr04 坐标: 46975768-46977181 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003044`
名称	SmilChr04G003044
描述	thaumatin-like protein 1
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	46975768 - 46977181 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023840`
GeneID	`131023840`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023840`
原始查询	`LOC131023840`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	thaumatin-like protein 1
产物	thaumatin-like protein 1
Arabidopsis	`AT4G38660` (AT4G38660) Pathosis-related thaumatin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830022] identity=54.8; qcov=1.05; evalue=1.31e-123; confidence=high
Rice	`Os09g0536400` - identity=56.3; qcov=0.924; evalue=6.15e-106; confidence=high
GO	GO:0005576 (extracellular region); GO:0006952 (defense response)
KEGG	-
Pfam	PF00314 (Thaumatin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023840

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.80000	`XP_057809435.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057809435.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057809435.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809435.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809435.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:46975970`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B109,B83,B94,C4
`Chr4:46975978`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C69
`Chr4:46976211`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B12,B22,B30,B98
`Chr4:46976406`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B44,B55,C2
`Chr4:46976451`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B42
`Chr4:46976544`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr4:46976631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B45,B97
`Chr4:46976847`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809435.1

327 aa

164

327

Thaumatin

PF00314 Thaumatin 31-236 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809435.1`	Pfam	`PF00314`	Thaumatin	Domain	31	236	2.1e-80	270.0	Thaumatin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953452.1
GATTAAGATTCCCTTTCCACTCACTCCTCTCCACTCATTACTACCTCCACTGCTCCTCCGTCGTCGCCGCCCTCCACCTTTAATTCATCCACCCAACTTTGGGGGAGGAGCAGCTGCACCACCACCACTATTATTACCCATTTCATTTCATTGCTCTACAAATTAAATGGCTTCTTACTTCAAGATTCTCTTGATCAGTCTTCTCATCCACATCTCCCAAGGTAAAGGAGTTAAAGGTGCAACATTCACATTTGTAAACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023840
ATGGCTTCTTACTTCAAGATTCTCTTGATCAGTCTTCTCATCCACATCTCCCAAGGTAAAGGAGTTAAAGGTGCAACATTCACATTTGTAAACAAATGTTCCCAAACCATTTGGCCAGCAATTTTAGGAAGCCCAGTGCTAGAGACCACAGGATTCGAGCTCCCGAAATCCGGCTCGCGCGCCTTCCAGGCCCCGACCGGCTGGTCCGGCCGCTTTTGGGGCCGTACCGGCTGCACCTTCGATGAATCGGGGCACGGCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809435.1
MASYFKILLISLLIHISQGKGVKGATFTFVNKCSQTIWPAILGSPVLETTGFELPKSGSRAFQAPTGWSGRFWGRTGCTFDESGHGSCATGDCGSGQLECNGAGATAATLAEFTLGSGSMDFYDVSLVDGYNLPMLIEVSGGSGQCASTGCVEDLNQRCPSELRTENGGACRSACDAFNTPEYCCKGEYGSPATCKPSMYSQAFKSACPKSYSYAYDDATSTFTCTAADYVITFCPSHPSQKSSKSDDAASSGSGSEAES...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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