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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003080`

染色体: Chr04 坐标: 47403834-47408435 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003080`
名称	SmilChr04G003080
描述	protein MODIFIED TRANSPORT TO THE VACUOLE 1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	47403834 - 47408435 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023875`
GeneID	`131023875`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023875`
原始查询	`LOC131023875`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein MODIFIED TRANSPORT TO THE VACUOLE 1-like
产物	protein MODIFIED TRANSPORT TO THE VACUOLE 1-like
Arabidopsis	`AT3G16270` (AT3G16270) ENTH/VHS family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820873] identity=51.2; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0232400` - identity=46.8; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0032588 (trans-Golgi network membrane); GO:0035091 (phosphatidylinositol binding); GO:0043130 (ubiquitin binding)
KEGG	-
Pfam	PF01417 (ENTH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023875

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057809492.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.80000	`XP_057809492.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057809492.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057809492.1`
5	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.40000	`XP_057809492.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:47405276`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,A24,C42
`Chr4:47405296`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,A24,C1
`Chr4:47405306`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr4:47406040`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr4:47406731`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B130,B56,B63,B96,C53
`Chr4:47407100`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B103
`Chr4:47407100`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B103

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809492.1

702 aa

351

702

ENTH

PF01417 ENTH 16-129 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809492.1`	Pfam	`PF01417`	ENTH	Repeat	16	129	3.9e-07	30.9	ENTH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953509.1
CAAAATTAGAAATTCAAGTTCTGTTAACAAAATAAATCAACCCCCCAAAAAAAGAATATCCCAATTCTCCGTTCCTTCCATTTCGATGAACATAGACCTCCGCGATCGCAAGGATTAACAACTCTATTAATCACTGGTCGGTCGACCGATCCTGTAGTAATTCGTTGAACAATCTGTTTGTTTGATTTGTAAATCGAGTCGGCGGATCGGCTAATCGATCGGTTTCTTTGGTGGAGTGAAAAAGTGATTTTGGTGAAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023875
ATGGAGCAGAGCAGGAGGGCAGTGGAGTCGTACTGGAGGTCCAAAATGATCGACGTCGCGACTTCCGACGAGGATAAGGTTACTCCGGTTTACAAATTGGAGGAAATATGCGATTTGCTGAGGTCTTCACACATTTCCATTGTTAAAGAGGTCTCCCAATTCATCCTCAGACGGCTTGATCACAAATCGCCGATTGTTAAACAGAAGGCATTAAGGGTCATCAAATATGCTGTGGGAAAGTCAGGTGCAGAGTTCAAAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809492.1
MEQSRRAVESYWRSKMIDVATSDEDKVTPVYKLEEICDLLRSSHISIVKEVSQFILRRLDHKSPIVKQKALRVIKYAVGKSGAEFKREMQKNSVSVRQLIHYRGQPDPLKGDALNKAVRETAQETLSTLFSSDDSTAAPTESSLRSRIQGFGNTNYEMPSDDRKSFISEVVDIGSATIRQGFSNLKQSPSIRKSNDTGSYRSPNLERSLTRENDYSDRYEGIGSHAEYNSSSRFSKNAGNGSWDEEISTSQSETSNGDPA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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