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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003082`

染色体: Chr04 坐标: 47420780-47424560 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003082`
名称	SmilChr04G003082
描述	tubby-like F-box protein 5
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	47420780 - 47424560 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023877`
GeneID	`131023877`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023877`
原始查询	`LOC131023877`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tubby-like F-box protein 5
产物	tubby-like F-box protein 5
Arabidopsis	`AT2G18280` (TLP2) tubby like protein 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816344] identity=63.3; qcov=1.01; evalue=1.28e-180; confidence=high
Rice	`Os02g0705300` (OsTLP8) - identity=67.6; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF01167 (Tub); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023877

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057809496.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057809496.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057809496.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057809496.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809496.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:47422203`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B119,B76,C16,C58,C8
`Chr4:47423528`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C54
`Chr4:47424035`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,A24,B58,C42
`Chr4:47424061`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B68
`Chr4:47424061`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B68
`Chr4:47424062`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,B103
`Chr4:47424096`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr4:47424190`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,A16,B27,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809496.1

412 aa

206

412

F-box

F-box-like

Tub

PF00646 F-box 53-96 aa PF12937 F-box-like 53-96 aa PF01167 Tub 114-407 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809496.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	53	96	0.00011	22.7	F-box domain
`XP_057809496.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	53	96	4.2e-07	30.3	F-box-like
`XP_057809496.1`	Pfam	`PF01167`	Tub	Domain	114	407	8e-103	344.3	Tub family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953513.1
TGGGATATAGAGGAAAGTATATAATATAAATATAAATATAGTTATCTAGAGAGAGAACCACATATTTAAAGGTGTGCATAGAAAGCAGGGCATGCTTCCGCTCACTATTGTGAAAGCAGCTGTTATTTCCTGTCTTCTCTGAGCTCGTGATCACAATTTGCTTTTATTTTCGTTAACACAGCGGAGACTGCGGCTCAGCTATGTATAGCTTAAACCTGAGAATTAGGGACGATGATTAGGTTTGGGTATTCACATTCCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023877
ATGTCATTCAAGAGCATTGTAAGGGAGCTGAAGGAGATGAGAGATGGGATTGGCAGCATGTCTAGGAGAGGGATTGAGGTGAAGCACTGGCGCAGCCATACGAGGTCTTTTGTAGCCCCTGATGTAATTCTTTCGGAGCCGATAGAGCAAGGGCAGTGGGCAAATTTACCACCAGAATTGCTTTTGGATATCATTAGGAGGGTTGAGGAGAGTGAGACTGCTTGGCCTGCTAGGGCGGTTGTTGTTTCTTGTGCATCAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809496.1
MSFKSIVRELKEMRDGIGSMSRRGIEVKHWRSHTRSFVAPDVILSEPIEQGQWANLPPELLLDIIRRVEESETAWPARAVVVSCASVCRSWRDVTKEIVKTPEECGRLTFPISLKQPGPRDAPVQCFIKRDRATSTYRLCFGLTPSEDESDKLLLTARKMRRATSTDFLISLVADDFSRASNTYVGKLRSNFLGTKFTIYDSQSPNDAAIQHRSRHSRRFNAKQVSPKLPAYNYSVATISYELNVLRTRGPRRMHCTMLS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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