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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003084`

染色体: Chr04 坐标: 47426035-47431308 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003084`
名称	SmilChr04G003084
描述	U-box domain-containing protein 5-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	47426035 - 47431308 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023878`
GeneID	`131023878`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023878`
原始查询	`LOC131023878`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	U-box domain-containing protein 5-like
产物	U-box domain-containing protein 5-like
Arabidopsis	`AT4G36550` (AT4G36550) ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829807] identity=33.7; qcov=1.06; evalue=6.35e-114; confidence=low
Rice	`Os02g0705600` (OsPUB29) - identity=35.2; qcov=0.967; evalue=1.17e-127; confidence=medium
GO	GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016567 (protein ubiquitination)
KEGG	-
Pfam	PF04564 (U-box); PF25598 (ARM_PUB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023878

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057809497.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057809497.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057809497.1`
4	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057809497.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809497.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:47426421`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr4:47426525`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,C44
`Chr4:47426595`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,C14
`Chr4:47426633`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B54,C59
`Chr4:47426633`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B54,C59
`Chr4:47426636`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr4:47426839`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr4:47426901`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B1,B43,D5
`Chr4:47426992`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr4:47427288`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr4:47427292`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C15
`Chr4:47427337`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,B41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809497.1

722 aa

361

722

U-box

ARM_PUB

PF04564 U-box 268-337 aa PF25598 ARM_PUB 490-679 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809497.1`	Pfam	`PF04564`	U-box	Domain	268	337	1.1e-17	64.6	U-box domain
`XP_057809497.1`	Pfam	`PF25598`	ARM_PUB	Repeat	490	679	5.4e-13	49.7	Plant U-box protein ARM repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953514.1
TTGATGGTTGACTGCTTCCACAACTTCAACCACCATTGCTACTCCCACAGTTCACCAAATTATCTTCTCGTCACGCCCAAATTCATGTAAACACCAAAAAAGCTAACAATTATAATAAAGAGACAATCTTTCTTCGTGGTTCCTGCTTTTGAGTTTTGACCACAATTAAGTAACTGATGCTTTAATTCCAAGAGCCCACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCATTCATTAAGAGAAAGCAAGGCGACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023878
ATGGGAAATCATGCCGAAATTATTGAAGGACTGCCACCAACTCAGACCATCAAGGTACACGCTCAAATGTGTTCAGAACTATATAAGGTGGTCGTCCGAGTTTCAAAGAATTTTCCAGAAATAGAATCAGCCCGCCCTCGATGCTCTTCAGGAATAGAGGCACTTTGCTTGTTAAACAATGGTATTGTCAAAGCCAAGTCTCTGCTGCAGCACTGTAGTGAGTCGAGTGTACTTTATCTGGCACTTACCGGAGAGGCAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809497.1
MGNHAEIIEGLPPTQTIKVHAQMCSELYKVVVRVSKNFPEIESARPRCSSGIEALCLLNNGIVKAKSLLQHCSESSVLYLALTGEAILSRCKKSRNLLEQSLCQIQSMVPVMLAAKISGIIADLRSAAFYLDPSEEEAGRVLRELLHRYGSTVDSTEEAALAAIHTVSSCLRISSQKALLIEKRSLKRLLDKFGENEPSKRKILIFFLNLLKKYGKVIAETQKDNASSERGNPFQITNPYLLTDDVDLRADYRSNEAHID...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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