当前解析结果
SmilChr04G003086| 统一新 Gene ID | SmilChr04G003086 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G003086 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G003086 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 47468702 - 47470622 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131023882 |
|---|---|
| GeneID | 131023882 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023882 |
| 原始查询 | LOC131023882 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023882 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057809502.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057809502.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057809502.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057809502.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057809502.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:47469421 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B106,C7 |
Chr4:47469426 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C83 |
Chr4:47469429 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B101,D11 |
Chr4:47469434 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B23,B25,C36,C8 |
Chr4:47469445 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr4:47469449 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B23,B25,C36,C8 |
Chr4:47469451 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 23 | A18,A20,A23,B101,B107,B120,B122,B2,B33,B55,B70,B95,C11,C27,C28,C35,C63,C69,C71,C74,C75,C84,D3 |
Chr4:47469453 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B25,B86,C6 |
Chr4:47469462 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A13,B98,C20,C48 |
Chr4:47469464 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A10,B15,B24 |
Chr4:47469487 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C6 |
Chr4:47469509 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A2,A24,C44 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。