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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003092`

染色体: Chr04 坐标: 47560053-47560957 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003092`
名称	SmilChr04G003092
描述	uncharacterized SmilChr04G003092
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	47560053 - 47560957 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023886`
GeneID	`131023886`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023886`
原始查询	`LOC131023886`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Putative methyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835018]; symbol=AT5G49560; hit=AT5G49560; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Putative methyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835018]; symbol=AT5G49560; hit=AT5G49560; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G49560` (AT5G49560) Putative methyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835018] identity=55; qcov=0.791; evalue=5.9e-80; confidence=high
Rice	`Os07g0569500` - identity=43.4; qcov=0.788; evalue=2.9e-47; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF10294 (Methyltransf_16)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023886

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057809504.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057809504.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057809504.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809504.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809504.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:47560144`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	B4,B51,B89,C19,C46,C56,C86
`Chr4:47560345`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B25
`Chr4:47560737`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B40
`Chr4:47560737`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B40
`Chr4:47560842`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C56
`Chr4:47560860`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	113	A1,A10,A13,A14,A18,A19,A2,A23,A25,A6,A7,A9,B10,B102,B105,B107,B109,B11,B111,B112,B115,B121,B122,B124,B125,B126,B128,B131,B132,B134,B135,B136,B138,B139,B15,B16,B19,B22,B23,B26,B28,B29,B30,B31,B33,B4,B40,B45,B47,B51,B54,B58,B60,B62,B64,B66,B69,B70,B71,B75,B77,B78,B8,B80,B84,B85,B91,B97,C11,C12,C15,C16,C17,C18,C19,C23,C26,C28,C30,C31,C32,C34,C37,C39,C40,C41,C42,C45,C46,C47,C48,C51,C52,C53,C60,C61,C67,C68,C69,C71,C73,C74,C75,C77,C80,C84,C86,D2,D3,D4,D5,D7,D8
`Chr4:47560878`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B137,B24,B48,B60,C27
`Chr4:47560878`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B137,B24,B48,B60,C27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809504.1

278 aa

139

278

Methyltransf_16

PF10294 Methyltransf_16 74-247 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809504.1`	Pfam	`PF10294`	Methyltransf_16	Family	74	247	1.3e-35	123.5	Lysine methyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953521.1
CGTGAATATCCGATCACCACTTGCACTAAATTACATGCCACCCAATAATCAACGATGTCTAAATCTACTTATACTTATTATCATATTCATAATAAAATTAATGCAAGTTGCAGTCCATGCTTATCTCTCTGTAATAAATTTGGCCGACTTCCCCAAACCCAAACCCTATCTCGCAATGTTAGAGGAAAATGATGGTGAGCAAGAGCAAGAGCAAGAGCCGCCGCCGCAAACCTACCTCCTGCAGTCGTTAAACTCAAGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023886
ATGCCACCCAATAATCAACGATGTCTAAATCTACTTATACTTATTATCATATTCATAATAAAATTAATGCAAGTTGCAGTCCATGCTTATCTCTCTGTAATAAATTTGGCCGACTTCCCCAAACCCAAACCCTATCTCGCAATGTTAGAGGAAAATGATGGTGAGCAAGAGCAAGAGCAAGAGCCGCCGCCGCAAACCTACCTCCTGCAGTCGTTAAACTCAAGCATAGTCATCCGCCAGCTCACCTCCCAAGGCATCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809504.1
MPPNNQRCLNLLILIIIFIIKLMQVAVHAYLSVINLADFPKPKPYLAMLEENDGEQEQEQEPPPQTYLLQSLNSSIVIRQLTSQGISFQLWPAAAALVALLERQTLSCLRTAEQRRLRVLELGSGTGLVGIAAAALLGANVTVTDLPHVLPNLQFNVDANAGVVAARGGQVQVAALSWGDVEQMEGVGGDFDVVLGSDLVYHDHLYEPLLQTLRVLLLGETQKQVVFVMAHLKRWKKESAFFKKANKFFHVEIVHRDNPP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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