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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003093`

染色体: Chr04 坐标: 47562564-47565348 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003093`
名称	SmilChr04G003093
描述	uncharacterized SmilChr04G003093
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	47562564 - 47565348 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023887`
GeneID	`131023887`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023887`
原始查询	`LOC131023887`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023887

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057809505.1`
2	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809507.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057809505.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809505.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809505.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:47563217`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	A2,B101,B109,B111,B23,B40,B49,B68,B71,B79,B8,C3,C42
`Chr4:47563469`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr4:47563479`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B84
`Chr4:47563626`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B76
`Chr4:47563846`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr4:47564114`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr4:47564243`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B136
`Chr4:47564243`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B136
`Chr4:47564270`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,B139
`Chr4:47564281`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,B139
`Chr4:47564335`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:47564342`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B4,C5,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809505.1

361 aa

180

361

FBA_3

FBA_1

PF08268 FBA_3 29-263 aa PF07734 FBA_1 60-223 aa

XP_057809506.1

361 aa

180

361

FBA_3

FBA_1

PF08268 FBA_3 29-263 aa PF07734 FBA_1 60-223 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809505.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	29	263	9.7e-18	64.9	F-box associated beta propeller domain
`XP_057809505.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	60	223	1.7e-14	54.3	F-box associated beta propeller domain
`XP_057809506.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	29	263	9.7e-18	64.9	F-box associated beta propeller domain
`XP_057809506.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	60	223	1.7e-14	54.3	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953522.1
ATCAATTAATACCCGTCGAAATTCGACGGGTTACACACTAGTTATATTTTTAGCAGATGATAACTTAGAATTGCAGAAGCAAATAGGATGTATGAATGGCATCTATCATCTCTTTGATCGCCATCACATCCTCACCAGTGGCAGGCACACCCACAAACCCCTTCATCAGGATCAGGACTACAATCCCCAAAGGGAGGCTAACGATGAGCACATGAGATCTCAAAATTTTACAATACCGCATGGCTGCACGCTTCGCCACC...

XM_057953526.1
GAAATTCGACGGGTTACACACTAGTTATATTTTTAGCAGATGATAACTTAGAATTGCAGAAGCAAATAGGATGTATGAATGGCATCTATCATCTCTTTGATCGCCATCACATCCTCACCAGTGGCAGGCACACCCACAAACCCCTTCATCAGGATCAGGACTACAATCCCCAAAGGGAGGCTAACGATGAGCACATGAGATCTCAAAATTTTACAATACCGCATGGCTGCACGCTTCGCCACCTCCGCTGCCAAGCGCTG...

CDS

5 records

下载 CDS FASTA

LOC131023887
ATGGGTTCATTTCTTTTTCGATACCGCATGGCTGCACGCTTCGCCACCTCCGCTGCCAAGCGCTGCCTTCCGATGCTTCCTTCTCTCTATGGCCAACGTGTTCGATCTAGCAATTGCTTCTGGGGCCCCAGAATCGGAACCCTAATTCAACAGACCAGCAGAGAGTGGGAAAGTAGGAAGGTGGGTCCGACGAGAATCTACGGTGCTGCGCCTACTTGGAAAAAGCTTGTGCCGCTAGGATATTTAATCGAAAATGAAGA...

LOC131023887
ATGGCTGCACGCTTCGCCACCTCCGCTGCCAAGCGCTGCCTTCCGATGCTTCCTTCTCTCTATGGCCAACGTGTTCGATCTAGCAATTGCTTCTGGGGCCCCAGAATCGGAACCCTAATTCAACAGACCAGCAGAGAGTGGGAAAGTAGGAAGGTGGGTCCGACGAGAATCTACGGTGCTGCGCCTACTTGGAAAAAGCTTGTGCCGCTAGGATATTTAATCGAAAATGAAGAGATTGGAGTTCTCCTTTCATTTGACTT...

Protein

5 records

下载 Protein FASTA

XP_057809505.1
MSSNGLSDHLFPNSKPVPYIYILHADEHEYMYFSAHSVEEDGTISSSPKYYVYPPSPLKETCYFTAVSCNGLLHFENLQHDDFLWNPTTNEFKALPDSSFDHQHPHGVVVTNIKLGCVMWSDNRCADNFKMLQLVLANTADGEDESSIDLSYHIHLYSLKTNSWKKIPCSEFFYLQGPGITINEVYYVPGYLIENEEIGVLLSFDFSTETLSSIPGPPIQNGWSCVIFLEYKGFFGYVPCWKDENEIPVRFELWVMKNGS...

XP_057809506.1
MSSNGLSDHLFPNSKPVPYIYILHADEHEYMYFSAHSVEEDGTISSSPKYYVYPPSPLKETCYFTAVSCNGLLHFENLQHDDFLWNPTTNEFKALPDSSFDHQHPHGVVVTNIKLGCVMWSDNRCADNFKMLQLVLANTADGEDESSIDLSYHIHLYSLKTNSWKKIPCSEFFYLQGPGITINEVYYVPGYLIENEEIGVLLSFDFSTETLSSIPGPPIQNGWSCVIFLEYKGFFGYVPCWKDENEIPVRFELWVMKNGS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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