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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003107`

染色体: Chr04 坐标: 47627519-47631822 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003107`
名称	SmilChr04G003107
描述	acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32-related protein
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	47627519 - 47631822 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023900`
GeneID	`131023900`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023900`
原始查询	`LOC131023900`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32-related protein
产物	acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32-related protein
Arabidopsis	`AT3G50690` (AT3G50690) Leucine-rich repeat (LRR) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824233] identity=63.1; qcov=0.867; evalue=1.63e-109; confidence=high
Rice	`Os07g0607800` (OSJNBa0072I06.32) - identity=58.2; qcov=0.557; evalue=5.26e-86; confidence=medium
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0042393 (histone binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF12799 (LRR_4); PF14580 (LRR_9)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023900

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809529.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057809529.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809529.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809529.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809529.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:47628233`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B97
`Chr4:47628233`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr4:47628342`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr4:47628389`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,B21
`Chr4:47630494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,C56
`Chr4:47630608`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr4:47630686`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr4:47630695`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B28
`Chr4:47630698`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B123
`Chr4:47630698`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B123
`Chr4:47630701`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr4:47630761`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809529.1

472 aa

236

472

LRR_9

LRR_4

LRR_1

PF14580 LRR_9 61-165 aa PF12799 LRR_4 71-114 aa PF00560 LRR_1 96-110 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809529.1`	Pfam	`PF14580`	LRR_9	Repeat	61	165	2.7e-11	44.1	Leucine-rich repeat
`XP_057809529.1`	Pfam	`PF12799`	LRR_4	Repeat	71	114	7.6e-13	49.0	Leucine Rich repeats (2 copies)
`XP_057809529.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	96	110	0.00034	20.8	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953546.1
GTGTATTGAAACGCTCCTATCAAAATACCAATGGCAATCTCGTAATATATAAGGAATCTAAAGGGCATATTCTTCTGCGCGCTGCCATATTTACACCGCCCAAGGAGACGTATCAGACTTGCCGAGCGCGTGACTTTCTCTAGCCTCAAAATTGTTCTTCCTTCCATTTAAAACAAACACACCATTCGTCCATCGCAACCGTCAATAATTCAACCACGTCATCGATCCTTGCTTTTCTAATCCTACGGTTCACATTCACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023900
ATGGATGAGATCTGGGAGAGGGCCGTGGAGACGGCGTTGGACGGCCAAACGGACATCGATTTGGTTCGGACGTTAACGCTCGACGGCGCGGTGAAGTGCGTCCACGGCCGTTTGCCGCCGCCGTCGCTCTTCGAAAAGTTCCACAATCTCCAGCACCTCTCTATGGCCAACATCGGCGCCTCGTCGCTGGAGCAGTTCCCCCGCCTCCGGAATTTGCAGAAGCTTATTTTGTCGGATAATCGGATCGCCGGTGGGCTCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809529.1
MDEIWERAVETALDGQTDIDLVRTLTLDGAVKCVHGRLPPPSLFEKFHNLQHLSMANIGASSLEQFPRLRNLQKLILSDNRIAGGLEFLVEAGLESLRDLDLSNNRISDINDLRPLAELRLVSLDLYECPVTRIKDYRSRVFGLIRSLKYLDKMDAEENERPESDDEEDDEEEEEDDPGSGEIDGEDHPFRLSNGQRAGSEGVVDVDEDEESDADEEEAETSRALNGLSRAGSSHHHSNGFKVEVVDGEDDEEEGEDEDD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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