当前解析结果
SmilChr04G003108| 统一新 Gene ID | SmilChr04G003108 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G003108 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G003108 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 47640206 - 47642840 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131023903 |
|---|---|
| GeneID | 131023903 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023903 |
| 原始查询 | LOC131023903 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | polyol transporter, putative (DUF1195) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829819]; symbol=AT4G36660; hit=AT4G36660; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | polyol transporter, putative (DUF1195) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829819]; symbol=AT4G36660; hit=AT4G36660; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT4G36660 (AT4G36660)polyol transporter, putative (DUF1195) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829819] identity=57.4; qcov=0.989; evalue=2.75e-63; confidence=high |
| Rice | Os07g0607500- identity=52.1; qcov=0.669; evalue=6.63e-28; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF06708 (DUF1195) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023903 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.80000 | XP_057809531.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.60000 | XP_057809531.1 |
| 3 | Chloroplast | 叶绿体 | 0.20000 | XP_057809531.1 |
| 4 | Chloroplast membrane | 叶绿体膜 | 0.20000 | XP_057809531.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057809531.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:47640577 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A22,B35,B88 |
Chr4:47640715 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B44,C70,D10 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057809531.1PF06708
DUF1195 9-157 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057809531.1 |
Pfam | PF06708 |
DUF1195 | Family | 9 | 157 | 2.5e-62 | 209.7 | Protein of unknown function (DUF1195) |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。