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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003113`

染色体: Chr04 坐标: 47679739-47684114 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003113`
名称	SmilChr04G003113
描述	phragmoplastin interacting protein 1
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	47679739 - 47684114 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023908`
GeneID	`131023908`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023908`
原始查询	`LOC131023908`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phragmoplastin interacting protein 1
产物	phragmoplastin interacting protein 1
Arabidopsis	`AT4G24770` (RBP31) 31-kDa RNA binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828579] identity=28.2; qcov=0.427; evalue=1.18e-14; confidence=low
Rice	`Os03g0123200` (OJ1126B12.13) - identity=38.1; qcov=0.363; evalue=2.25e-36; confidence=low
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1); PF00098 (zf-CCHC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023908

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809537.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057809537.1`
3	Nucleolus rim	Nucleolus rim	0.20000	`XP_057809537.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809537.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809537.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:47681089`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:47681166`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B120,B87,C36
`Chr4:47683232`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr4:47683234`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B50,B6,B93,C63
`Chr4:47683806`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B120,B87,C33,C36
`Chr4:47683956`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809537.1

499 aa

250

499

RRM_1

zf-CCHC

PF00076 RRM_1 226-294 aa PF00076 RRM_1 321-389 aa PF00098 zf-CCHC 470-487 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809537.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	226	294	1.6e-27	95.9	RNA recognition motif
`XP_057809537.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	321	389	1.6e-27	95.9	RNA recognition motif
`XP_057809537.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	470	487	2.7e-05	24.8	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953554.1
AAAGAAAAAGAAAATCGAGGAGCTTCGGGTAAGAAGTTAGAATTACGAGGGGTTAGTTGTTAAATTAAAAAGCTTGAGAGGTCGAAGCGAATTAATGAACAATGGTAAAAACCCAAGTATAACCTGCCGCCGCCGCACGCCTCCGTTCCGCCAACCTTATTCCGTTTTATTACGCGGCCACCGTACTCAAGGTCAAGCTGAGAAAGAGAGAGAGTGTGTCCGGCGAAGGTGGGAATCCGCAGCGTCTGCCCATTTGATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023908
ATGGTATTATCAAACAAGAAGCTGAAGGAGAAGCTACGATCTGCTAAAGCTGTAATAGTCACAGTCTCGGGAGCTCAGAATAACTTCACCGACAAAACTAATGAGAAATCCCAGGCCTTTGCTTCTAAAGCATCGGATTCCTTGAGGGCTATCCAGAATCTAGAGGCACAAATGTCCAGATCTAAAAGAGAAAAACCTAAAAGAGTAAAACAAAAGCGAAAGGCGTTGACTGAGAATAAAGACATTATTAAAAATGGAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809537.1
MVLSNKKLKEKLRSAKAVIVTVSGAQNNFTDKTNEKSQAFASKASDSLRAIQNLEAQMSRSKREKPKRVKQKRKALTENKDIIKNGEISGDVEVKLQNGLNSDTMQEKKKMKKRKNDESEASENVKKKRKKKRDESETLENVKKKGDESEASENVKKKKSNKKKKRPRQWWMIKKRNNDNKKTEEAENGAVNEGNQNESRSTAEQLVANADVSIASRKNIETSQKVYVGGIPYYSNEDDIRSYFEGCGTITCIDCMTFPD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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